重茬栽培使土壤中菌源积累，加重了病害发生：保护地复种指数高，轮作换茬有困难，连年重茬栽培使土壤中病菌含量不断增加，加上保护地高温高湿的小气候，适宜病害发生，引起病害加重。
不当的栽培方式、不合理的灌溉方法给病害发生创造了条件：据调查，一般平畦栽培发病重于高垄栽培，大水漫灌或灌水次数多的田块发病也较重。
定植时期过早也是造成辣椒死棵的原因之一：近年来，部分菜农只顾一味赶早，盲目的提早了播期和定植日期。尤其是去年我省昌乐尧沟等地，多数菜农均在7月中旬已经定植，由于光照强，气温闷热，空气湿度大，再加上定植过深，导致的黄叶死棵现象严重。
生长期内病菌感染：根据近几年调查研究，目前在寿光市引起辣椒死棵病的病原有2类3种。
一类是细菌侵染，如青枯病。该病多从枝条顶端叶片开始萎蔫，伴随整株叶片同时萎蔫青枯，病程较短。病茎外表症状不明显，纵剖茎部维管束变为褐色，横切面保湿可见乳白色粘液溢出。另一类为真菌病害，主要有枯萎病、疫病和菌核病3种。枯萎病发病初期下部叶片大量脱落，与地面接触的茎基部皮层呈水渍状腐烂，地上部茎叶迅速凋萎。疫病在辣椒整个生育期均可发生，以坐果后最易受害。成株期受害时，病部形成长条形斑，病健交界处明显，病斑凹陷或稍缢缩，病株叶片萎蔫脱叶致死亡。菌核病菌核病为害茎部或枝叉处，湿度大时，病部长出白色菌丝体，后期可长出黑色鼠粪状菌核，最后植株枯死。
其中疫病的发病比例最高，约占死棵田的70%，这种病发病快，特别是高温浇水后，数小时就可以大面积感病，不仅幼苗可以感病，而且成株的茎、叶、果均可感病，传播速度也较快，为害较大；其次是根腐病，约占死棵田的20%，一般是挂果后开始萎蔫，主根发生褐色病变，根皮容易剥离，使椒果不能正常成熟，根腐病具有病程长、前期难发现的特点，一旦发现为时已晚，所以早防是至关重要的；青枯病和枯萎病发生的比例很小，但青枯病是细菌性病害，不仅传播快，而且病程短、死得快，经常是毁灭性灾害。
具体防止措施
防治辣椒死棵就是要同时防治这几种病害。要防治首先要了解这几种病害的特点：这几种病害都能借水传播，病源菌多在土中，能在土中侵染辣椒根系，而像疫病、青枯病，还可以直接侵染辣椒的茎叶等地上部器官，可以说它们能够全方位地侵染辣椒；根腐病、疫病可以在苗期侵染辣椒，也可以在成株期侵染辣椒，可以说是在辣椒的整个生育期都可侵染。
在目前的生产实践中，有的菜农用嫁接来防止死棵，有的用药剂熏蒸处理土壤来防治，各用利弊。经过调查研究和实践检验，有关专家总结了一套防治辣椒的死棵的技术，在这里介绍一下。这种方法针对死棵病菌的全生育期侵染的特点，在防治上采取从地下到地上全方位、从下种前到收获后全生育期防治的策略。其具体做法是：
一、清洁苗床：虽然这几年购买成品苗的农民越来越多，但多数农民仍然是自己育苗。自己育苗就要注意苗床干净，首选是新土，其次是苗床处理消灭病菌，可用苗菌敌等药剂。
二、移栽用药：适量的向农4号，移栽时穴施，每亩1000～1500克，施用前可先掺土拌药，以方便使用。
三、加强灌药：定植后一个月，再用以上药剂灌根，稀释倍数600～800倍，同时也可叶面喷施。
四、定期喷药：定期喷药预防，可选用广谱性杀菌剂大生—M45等，或向农4号800倍，每隔7～10天喷一次。
当然，辣椒的死棵与所种植的品种有一定的关系，但采用以上方法，做到了全方位全生育期的防治，可以使辣椒死棵现象基本不发生。
