1.直接原因
（1）虫害。造成水稻穗枯死的虫害主要有：螟虫（三化螟、二化螟、大螟）、褐稻飞虱、蝼蛄等，其中螟虫以二化螟为主，以幼虫蛀食茎秆造成白穗，拔起白穗可见断口处有明显虫咬痕迹。褐稻飞虱以成、若虫聚集水稻基部刺吸汁液为害，严重时造成植株基部组织破坏、腐烂，同时诱发基腐病、菌核病，常造成田间水稻局部或连片枯死。蝼蛄为害主要集中于田埂边，咬断近地表茎秆，造成整棵枯死。
（2）病害。造成水稻穗枯死的主要病害有：穗颈瘟、节瘟、恶苗病、细菌性基腐病、小球菌核病、纹枯病等，其中穗颈瘟在水稻抽穗期侵染危害，致使穗颈褐变坏死形成白穗，危害枝梗可造成稻穗局部枯死；节瘟主要危害穗下1、2节，致茎节变黑干缩，形成白穗、瘪粒；恶苗病危害的植株一般到拔节孕穗期陆续整株枯死，发病轻的就可推迟到灌浆期显现症状，形成白穗、瘪粒；细菌性基腐病穗期危害，致使基部茎节病变，植株失水形成枯孕穗、白穗，病株根节有恶臭味，并生有少量较短的侧生根。小球菌核病一般危害基部茎秆，致使茎秆整段变黑腐朽，易拔断，造成全株枯萎或贴地倒伏枯死，剖开叶鞘和茎秆的腐朽组织，可见大量黑色菌核。纹枯病在苗期至穗期都可感染发病，主要危害叶鞘、叶片，也危害茎秆，病斑呈云纹状，穗期发病严重时，可造成整株枯死，形成死孕穗或白穗瘪粒，湿度大时，病部长出白色网状菌丝，后形成褐色菌核。
（3）药害。主要是由药剂使用不当造成的。一是用药浓度过大造成局部植株严重灼伤死穗；二是误用除草剂造成植株连片整株枯死。
2.间接原因
（1）品种缺陷
生产上，任何一个水稻品种的育成都不可是十全十美的，总会存在这样或那样的缺陷，特别是在抗病性方面，育种家很难把多种抗病基因集中到一个品种上，而且某些病害到目前为止还没有发现明显的抗性基因。如近年来推广的水稻品种“津稻1007”，就存在重感条纹叶枯病缺陷，“丰优2000”、“吉粳803”等存在易感穗颈瘟缺陷，目前还没有育成明显抗纹枯病的水稻品种。
（2）肥料失衡
主要表现为有机肥施用过少，氮肥施用量过大，造成植株生长柔嫩，抗性下降，诱发和加剧稻瘟病、恶苗病、螟虫、稻飞虱、纹枯病等发生危害。
（3）水管不当
表现为长期深水灌溉，影响养分吸收；烤田时间推迟，高峰苗过大，田间郁蔽，致使稻株生长纤弱，硅质化降低，抵抗力下降，诱发和加重水稻纹枯病、基腐病、稻瘟病、螟虫和稻飞虱等危害。
水稻穗枯死预防措施
1.选择优良品种，规避种子缺陷
生产上尽可能推广抗多种病虫害的品种，特别是抗当地的常年发生危害较重的病虫害的品种，如“吉粳52”、“高优35”等。对生产上已经推广应用的品种，要针对各品种的抗性缺陷，有重点地做好防治工作，同时采取特定的栽培措施规避和减轻某些病害的发病率和发病程度。如推广旱育秧、抛秧、机插秧等技术，规避水稻条纹叶枯病、黑条矮缩病等危害。
2.强化栽培管理，增强植株抗性
一是推广肥床旱育秧，培育适龄壮秧，及时抛栽。二是推广配方施肥。做到有机肥与化肥配合使用，氮、磷、钾三要素配合施用，大量元素与硅、锌等微量元素配合施用，施足基肥，早施分蘖肥，看苗、看天、看田巧施穗肥，促进稻株稳健生长。三是加强水分管理。做到前期浅水勤灌，促有效分蘖；够苗后及时适度烤田，控制无效分蘖；后期湿润灌溉，不过早断水，养根保叶，改善水稻生长环境，提高稻苗素质，增强稻株抗性，避免长期深水灌溉。四是推广水旱轮作，清除田间稻茬，减少田间虫源、菌源。
3.加强病虫测报，坚持科学防治
农业部门要认真抓好本区域内的水稻病虫害监测工作，做到准确预报，及时防治，对症用药。一般对显症后无法用药控制的病虫害如恶苗病、穗颈瘟、节瘟、基腐病、菌核病、螟虫等，要坚持预防为主；对显症后可以用药控制的病虫害如纹枯病、稻飞虱等，要坚持治控为主。恶苗病重点用恶线清、咪鲜胺等高效药剂浸种，浸种要做到“三足”，即药量足、水量足、浸种时间足。纹枯病推广应用井冈霉素，控制纵向发展，保护功能叶。穗颈瘟、节瘟、二化螟等重点抓好破口期两次用药，可用25%使百克加40%毒死蜱混喷，虫病兼防。基腐病、菌核病在孕穗初期用50%氯溴异氰尿酸或50%多菌灵等防治。稻飞虱要依据病虫情报，在卵孵化值2龄盛期用5%大功臣或25%扑虱灵等单喷或混喷防治。大力开展以村为单位的统防统治工作。
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