心腐病 症状：发病初期芹菜心叶叶脉间变褐，叶缘细胞逐渐坏死，呈黑褐色，最后心部腐烂。这是由缺钙引起的生理性病害。连作田块不注意施用钙肥；雨水冲失土壤中有效的钙元素；植株施氮过多、缺乏水分供应或发生根腐病、根结线虫病，根系不能正常吸收钙元素，这些因素均能造成缺钙。防治方法：施用含钙量较高的肥料；及时浇水和防治病虫；发现缺钙，及时喷施叶面肥补钙，同时每隔20天喷施1次0.2%的磷酸二氢钾溶液。
缺硼 症状：发病初期叶柄异常肥大、短缩，并向内侧弯曲；弯曲的部分内侧组织变褐，逐渐龟裂，叶柄扭曲以至劈裂，严重时幼叶边缘褐变，心叶坏死。这是由缺硼造成的生理性病害。不少地区由于长期单一种植需硼量大的作物，土壤中有效硼含量偏低，加上不注意施硼肥，发病较普遍。防治方法：播前每亩施多元硼肥1公斤作基肥，生长前期叶面喷施0.1%~0.3%的多元硼肥溶液2~3次。
黑腐病 症状：病状多发生在根茎部和叶柄基部，有时也危害根部。病部变黑腐烂，其上生许多小黑点。植株生长停滞，外部1~2层叶片因基部腐烂而脱落。该病为真菌性病害。防治方法：除通过选用抗病品种、种子处理、科学管理等农业措施防治外，在发病初期可用50%甲基托布津可湿性粉剂500倍液或可杀得 （77%氢氧化铜可湿性粉剂）500倍液喷雾防治。
