1、选用无病种子或采用存放2年以上的陈种子播种。带病种子播种前必须进行消毒，温汤浸种，用49℃温水浸种30分钟，边浸边搅拌，然后移入冷水中冷却，晾干后播种。
2、排开播种，躲过病期。把传统的春季一次播种、年内分期劈叶收获的方法，改为排开播种分期收获的方法，从而躲过病期。如早芹菜3月育苗，4月中旬定植，6月上旬收获；二茬芹菜4月中旬播种，7月上旬收获；伏芹菜入伏前播种，9月收获。这样，在7、8月斑枯病的流行期，早芹菜和二茬芹菜早已收完，而伏芹菜苗小，利于通过田间管理避免危害。
3、加强田间管理。合理密植，及时间苗、除草，降低小气候的湿度，增强植株抗病力。施足底肥，及时追肥，注意磷、钾肥的配合使用，培育壮苗，雨后及时排水，大棚内注意通风排湿，及时清除田间病株、病叶（收获后清除病残体），集中沤肥或深埋，压低田间菌源。
4、药剂防治：出苗后和移栽前喷洒50%硫悬浮剂200-300倍液，或0.5:1:200波尔多液进行预防保护，带药定植。发病初期喷75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或40%多菌灵可湿性粉剂500倍液、60%乙磷铝可湿性粉剂500倍液、40%硫悬浮剂500倍液。大棚内可用45%百菌清烟剂熏烟，每亩每次用200-250克，隔7-10天熏1次，连续2-3次。
