一、合理轮作。将茄果类、瓜类、豆类等深根性作物与白菜类、绿叶菜类、葱蒜类等浅根性作物进行轮作，减轻病害发生，提高单位面积产量和品质。
二、改进栽培制度。⑴改变栽培时期，错过发病期进行种植。⑵深沟高畦栽培法，采用小水勤浇，避免大水漫灌。⑶合理密植，改善作物通风透光条件，降低地面湿度。⑷清洁田园，拔除病株，并对病穴采取消毒处理。⑸适当增施磷、钾肥，避免偏施氮肥，提高作物的抗病性。
三、利用抗性品种和嫁接换根技术。选用抗病、优质、高产品种，是提高抗病能力的前提，也是防治土传病害最为经济有效的措施。利用嫁接技术防治根系病害，选择高抗根结线虫和根部健壮的品种作为嫁接砧木，如用黑籽南瓜嫁接黄瓜等已有多年成功的经验。特别在病害流行年和地区，与其他防治措施结合，是蔬菜稳产和丰产的重要保障。
四、土壤消毒
1、大水浸泡：有条件的地方，可利用作物休闲的季节，进行长时间的土壤浸泡，能显著地消灭土壤中有害杂菌与病虫。
2、夏季高温闷棚技术：温室大棚在高温季节晴天的上午，土壤翻耕浇水后，密闭棚膜，使棚内温度高达70℃以上，以杀死棚内和土壤中部分病菌和虫卵。闷棚时间一般掌握在15-20天，1个月更好。
3、湿热杀菌法：可以有效的杀死土壤中的各种线虫、有害真菌和细菌，解决重茬蔬菜死苗的难题。具体方法：在冬春茬蔬菜拉秧后进行，每亩撒施100千克生石灰粉，10-15立方米生鸡粪或其他畜禽粪便，植物秸秆3000千克，微生物多维菌种8千克，喷施美地那活化剂400毫升。用旋耕梨旋耕一遍，使秸秆、畜禽粪便、菌种搅拌均匀，然后深翻土地30厘米，浇透水，盖上地膜，扣严棚膜，保持一个月左右，去掉地膜，耕地一遍，裸地晾晒一周，即可达到杀灭病菌、活化土壤的效果。该法对蔬菜重茬导致的土传病害具有明显的防治效果，其中对危害黄瓜最严重的嫁接黄瓜根腐病和根结线虫病防效最好。对于嫁接口细菌性腐烂病也有明显效果。
五、药剂防治。可根据病害种类，选用相应的药剂，在播种前进行土壤消毒，生长期进行喷雾和灌根。灌根方式除采用淋施外，还可将喷雾器的喷头取下，直接用喷雾杆施药灌根。在生长期防治如根腐病可选用药剂为：恶霉灵、立枯净、DT等药剂；防治枯萎病、黄萎病可选用药剂：增效多菌灵、DT、络氨酮水剂等；防治疫病可选用药剂：甲霜酮、百菌清等；防治青枯病的药剂：世高、氯溴异氰尿酸、DT等。
