首先，整枝打杈要避免在早晨棚室未通风前湿气较大时进行。一般情况下，上午9时以前棚室尚未通风，湿度较大，若此时整枝打杈，伤口难以干燥，易感染细菌性病害。因此，整枝打杈最好在上午棚室通风后进行。
其次，整枝打杈要避免在阴雨天进行。阴雨天棚室内湿度长时间居高不下，最易造成细菌性病害的流行。若在此期整枝打杈，留下的伤口极易染病。因此，在为蔬菜整枝打杈时一定要选择晴好天气。
最后，整枝打杈要避免在浇水后立即进行。浇水后1~2天，棚室内湿度通常较大，此时也不利于整枝打杈，最好在浇水3天后棚室内较干燥时进行。另外，还要注意在进行整枝打杈前，喷施一遍保护性杀菌剂，如72%的农用链霉素3000倍液、75%的百菌清600倍液混加琥胶肥酸铜(DT)500倍液等，可有效防止病害暴发，做到防患于未然。
