农业防治 实行美洲斑潜蝇喜食的瓜果、豆类等蔬菜与非喜食的十字花科、百合科等蔬菜合理轮作；适当稀植，增加田间通透性；生长期发现有虫叶及时摘除；勤中耕，增加灌水次数，消灭虫蛹；收获后及时清理田园，把被美洲斑潜蝇危害的作物残体集中深埋或烧毁。
黄板诱杀 美洲斑潜蝇成虫对黄色具有趋性，可利用这一习性进行诱杀。如可在棚内吊一块20厘米×2厘米大小的黄板，在其上涂上一层黏油（用10号机油加少许黄油调匀）进行诱杀。
药剂防治 美洲斑潜蝇世代短，繁殖力强，且抗药性发展快，药剂防治的关键是抓早，重点抓好苗期的防治，喷药时间最好在上午9~11时。常用药剂：48%乐斯本乳油800~1000倍液、25%斑潜净乳油1500倍液、1.8%爱福丁乳油3000倍液、40%绿菜宝乳油1000倍液、5%来福灵乳油3000倍液、20%康福多4000倍液等。
