秧田期间的烂秧指烂种、烂芽和死苗。以现青出苗期为界，烂种、烂芽出现在现青出苗之前，死苗发生在现青之后，特别是二、三叶期比较严重。
烂种是盲谷（哑谷）落田后，不发芽就腐烂。烂芽是芽谷落田后，未扎根转青就死亡。
烂种的主要原因为，种子成熟不良或机械损伤，或在贮藏过程中爱潮发霉等，降低或丧失发芽力；晒种和浸种时没有晒燥浸透，影响发芽势和发芽力；在催芽过程中，温度过高，造成种谷“吃热”酒精中毒或温度低，水分过多，供氧不足“现糖”使种谷失去发芽力。烂芽的原因较为复杂，其主要有下列几种：芽谷落田后，深水淹灌，低温缺氧，芽鞘徒长，根不入泥，翻根倒芽，秧板过烂，塌谷过深，种芽陷入泥中；或秧板过硬，不易扎根，造成倒芽、烂芽；或由于菌、虫危害，造成烂芽。秧田施肥过量及施后不久下种，造成毒害谷芽，种根发黑，幼芽枯黄。
上述种种均会造成种芽活力降低，引起病菌的浸害而造成烂芽。
