大蒜常见的根茎害虫有种蝇、根螨、茎线虫和粪蚊。现将它们的危害症状及防治方法分述如下：
种蝇。种蝇又称地蛆、蒜蛆、葱蛆，危害大蒜的有种蝇和葱蝇。这两种种蝇形态相似，幼虫为乳黄色的蛆，体长0．7～0．9厘米，尾部有7对肉质突起。幼虫在地下危害大蒜鳞茎，致使蒜头组织逐渐溃烂，心叶因失去养分供应而发黄，严重的整株枯死。防治方法：一是已经少量发生种蛆危害的田块，改施各类粪肥为施精制有机复合肥，如合缘酵素菌生物有机复合肥等，或施多元复合肥；二是667平方米（1亩）用地特灵颗粒剂800～1000克，与细土拌成毒土，撒施或沟施于根际；三是用40%卡本斯乳油200～250克兑水200公斤灌根，持效期达2～3个月；四是水源充足的地方，可连续灌水2～3次，每次水浸24小时，使种蛆窒息而死，而后应尽快排水。
根螨。根螨既是田间害虫，又是储藏期间的害虫。成螨卵圆形、白色，一般在蒜瓣基部缝隙处产卵入侵，最适宜发育危害的气温为15～20℃。它们蛀食鳞茎使之腐烂发臭，致使地上叶片枯萎，严重的枯死。储藏时鳞茎遭受危害，蒜瓣干枯成空壳。防治方法：一是用40%速效硫磷乳剂1000倍液喷洒，二是667平方米用速效硫磷70毫升与细土拌成毒土沟施。
茎线虫。茎线虫有多种，但以圆葱茎线虫危害较多。其体似蛔虫，两端较尖，靠蠕动爬行。成虫或幼虫从大蒜茎盘、鳞茎或叶片气孔入侵产卵，幼虫蛀食茎叶，使鳞茎变褐腐烂，叶片褪绿变形。防治方法：一是用40%速效流磷乳油1000倍液喷杀，二是667平方米用地特灵颗粒剂800～1000克与细土拌成毒土撒施。
粪蚊。粪蚊成虫喜欢在潮湿、弱光、有腐烂物质的生态环境处活动，在土壤表层产卵。幼虫黄褐色，无足，靠蠕动入侵蛀食假茎基部和鳞茎，致使大蒜植株枯萎，鳞茎变软、变褐、腐烂，瓣肉裸露甚至腐烂。防治方法：一是精细中耕除草，创造土松草净的环境，抑制虫卵孵化和幼虫活动；二是用50%辛硫磷乳油800倍液灌根杀死幼虫，或者667平方米用40%卡本斯乳油200～250克兑水200公斤灌根。
