如果忽视果树需要的各种营养的供求平衡，树体的生长发育就会发生障碍，并会花芽分化不良，发生多种生理病害，果实品质下降。例如，在给果树施肥时，如果施氮肥，就还要考虑结合施用适当比例的磷、钾肥料。通过施肥可使果树需要的多种营养达到平衡。
如果给果树施有机肥，有机肥固然含有果树需要的多种营养素，但有机肥料肥效发挥迟缓，所以在施有机肥料的同时，还需要混合施用一些无机肥料。土壤里施有机肥，有损伤树根的问题。在果树行间种草或种绿肥，则可既能增加土壤有机质含量，改善土壤物理性状，也还能供给果树多种营养素。
在果树年生长周期中，氮素是树需要最多的营养元素。开花前施氮肥，能促进新梢生长，提高坐果率；在花芽分化前适量施氮肥，可促进花芽分化，提高果实质量；采果前2～3周适量施氮肥，可提高单果重，增加产量；果实采收后施氮肥，可增加贮藏营养。果树固然需要大量的氮素营养，但不是单一施氮肥或大量施氮肥，就可以获得丰产优质果品。单一偏施氮肥或过多施氮肥，反而会降低坐果率，影响花芽分化；同时还会影响果品的产量和质量。给果树施氮肥，施用多少合适？要看果园的土壤肥力情况，还要考虑与其它肥料配合使用的比例。
如果施氮肥时，氮、磷、钾肥配合的比例适当，可增产10％～20%。配合施磷、钾肥，可以增加苹果树吸收根在总根量中的比例；减轻苹果树腐烂病；提高果实着色面积和着色程度，增加果实含糖量和果实硬度。施用氮、磷、钾肥的比例，幼龄苹果树应为1∶2∶1，成龄苹果树为2∶1∶2。
苹果树缺钙，叶尖、叶缘会变黄，焦枯坏死，树易早衰；果实成熟时易腐烂。树缺钙素营养需补钙，可在盛花后3～4周和采果前4～10周，分别喷0.5%硝酸钙，但要结合土壤施肥施入适量硝酸钾，则减少病果率的效果会更好，说明果树要健壮生长，需要多种营养元素。
苹果树缺硼症，也会营养失调引起生理病害。缺硼的直接原因，是土壤中可溶性硼的含量不足。当土壤是偏碱性土壤并缺乏有机质，或偏施氮肥时, 可溶性硼的含量就会明显下降，以至造成缺硼症的发生。防治缺硼症，可在盛花期喷硼砂液、叶面喷硼砂液，或往土壤里施硼砂。此外，还应改良土壤，早春适时灌水，提高土壤中可溶性硼的含量。避免偏施氮肥，也是不可忽视的问题。
果树体内缺少某一种营养素，或某一种营养素不足，则不能正常健壮生长，但是，若某一种营养素供给过量，也会引起不良后果。
