畸形 常见的有偏头瓜、扁形瓜、尖嘴瓜、葫芦瓜。偏头瓜一侧发育正常，另一侧发育停滞，是因子房发育不良、授粉不均和受精不良引起的。扁形瓜横径大于纵径，低节位雌花坐瓜或坐瓜期气温较低时易形成。尖嘴瓜的花蒂部位变细，果梗部位膨胀，瓜膨大期养分供应不足以及高节位坐瓜时易形成。葫芦瓜的顶部接近花蒂部位膨大，而靠近果梗部较细，呈葫芦状，是因受精不良引起的。防控措施：在花芽分化的2～4片真叶期，棚内夜间温度保持在13℃以上，水肥供应适当；控制坐瓜节位，选择第二至第三朵雌花授粉留瓜，植株生长势较差的适当推迟留瓜节位，反之可提前；晴天上午8—10时进行人工辅助授粉，阴雨天可推迟到8—11时，授粉量要足，授粉时温度保持20～30℃，以提高花粉活性，授粉后次日下午如果雌花果柄弯曲下垂表明授粉成功，如果果柄仍向上或向前伸直应重新授粉；及时翻动幼瓜，以矫正瓜型；坐瓜期遇旱及时补充水肥，并增施磷钾肥，最好采用膜下软管滴灌。
空洞 表现为瓜瓤开裂，并形成缝隙空洞。除与大果型品种本身有关外，低温、氮肥过多引起旺长的情况下坐瓜容易产生空洞。防控措施：大棚栽培西瓜宜选用中小果型品种，如小兰、特小凤、早春红玉、早佳（8424）等；坐瓜期棚温白天保持25～35℃，夜间保持18～20℃，低温或干旱条件下适当推迟坐瓜节位；及时整枝，一般采用三蔓整枝；健全沟系，防止连续阴雨天气水肥碰头导致植株旺长；瓜有鸡蛋大时疏瓜，头批瓜每株选留1个。
裂瓜 表现为从瓜蒂处产生龟裂，通常瓜皮薄的品种和小果型品种易发生。产生原因有多种，一是瓜膨大初期遇低温，发育一时停止之后再迅速膨大引起裂瓜；二是瓜膨大后期到采收期浇水不当，使吸水量和蒸发量不均衡而引起裂瓜；三是瓜发育的某一阶段遇旱发育受阻，突然大量灌水后使土壤水分剧增而引起裂瓜。防控措施：选择适宜品种；人工授粉，尽量不用激素喷花；瓜膨大初期温度保持在20℃以上，适量浇水，最好采用膜下软管滴灌；瓜成熟期遇高温干旱天气可撤去大棚裙膜，保留顶膜，禁止田内墒沟大水漫灌；瓜套袋，采摘及运输过程中尽量减少碰撞。
瓤质劣变 表现为瓜肉特别是种子周围的瓜肉呈水渍状，紫红色至褐色，严重时溃烂。主要是土壤水分急剧变化使根系活力下降，再遇高温使瓜瓤产生乙烯，引起异常呼吸而使瓤质劣变。植株感染黄瓜绿斑驳花叶病毒时，也会发生“水浸瓤”现象。防控措施：瓜应避免阳光曝晒，必要时用秸草遮盖；瓜膨大期增施有机肥，配施磷钾肥，适时适量浇水或膜下软管滴灌；浇膨瓜水后及时通风，待水完全下渗后再提高温度，避免土壤水分急剧变化，防止根系活力下降；及时防治传毒昆虫蚜虫、烟粉虱，并喷施吗胍·乙酸铜预防病毒病。
脐腐 主要表现为瓜顶部凹陷，变为黑褐色，湿度大时遇腐生菌寄生出现黑色霉状物。瓜膨大期缺水缺钙易发生脐腐。防控措施：增施腐熟有机肥与过磷酸钙；畦面覆盖地膜促进保墒，均衡供应水肥，遇旱适时膜下软管滴灌；叶面喷施1%过磷酸钙溶液。
