西瓜在生长结果过程中很容易患上一种叫做枯萎病的真菌病，该病通过土壤传播，病菌在土壤中的残留时间长达3～5年。在种过西瓜的土壤里往往残留大量的枯萎病菌，如果下一年再种，西瓜就特别容易感染发病，造成死苗，所以种西瓜的地块最好年年换。种过西瓜的地，最好换茬种植水稻、玉米等禾本科作物，也可以是土豆、白菜等蔬菜作物，但不宜种植瓜类蔬菜，以降低枯萎病菌的存活率。如果实在不能轮作换茬，可以选用对枯萎病抗性较强的某些葫芦科作物的幼苗作砧木,来嫁接西瓜。
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