用氢氧化钠、氨、石灰、尿素等碱性化合物处理秸秆可以打开纤维素、半纤维素与木质素之间的对碱不稳定的酯链，溶解半纤维素和一部分木质素，使纤维素膨胀，从而使瘤胃液易于渗入。强碱，如氢氧化钠可以使多达50%的木质素水解。化学处理不仅可以提高秸秆的消化率，而且能够改进适口性，增加采食量。目前应用较为普遍的是碱化法和氨化法。
一、秸秆的碱化处理。碱化处理是用碱溶液处理秸秆，使植物细胞壁变得松散，易被消化液渗透，秸秆经碱化处理粗纤维消化率可提高到50%以上，同时增加采食量20%~45%。
1、氢氧化钠液处理法。100千克切碎秸秆，用6千克1.6%的氢氧化钠溶液均匀喷洒，堆放6~7小时后在清水里淘洗一遍，洗去余碱，制成饼块，分次饲喂。秸秆经碱化处理后，有机物质的消化率由原来的42.4%提高到62.8%，粗纤维的消化率由原来的53.5%提高到76.4%。
2、石灰液处理法：用100千克切碎的秸秆，加3千克生石灰或4千克的熟石灰，食盐0.5~1千克，水200~250升，浸泡12小时或1昼夜，捞出晾24小时即可饲喂，不必冲洗。
二、秸秆的氧化处理。秸秆的氨化处理是成本低廉、经济效益显着的粗饲料加工方法之一。氨化的原理是利用氨溶于水中形成强碱氢氧化铵，使秸秆软化，秸秆内部木质化纤维膨胀，提高秸秆的通透性，便子消化酶与之接触，因而有助于纤维素的消化；氨与秸秆有机物产生作用，生成铵盐和络合物，使秸秆的粗蛋白质从4% 提高到8%以上，从而大大改进饲料秸秆的营养价值。秸秆氨化后可提高消化率20%左右，采食量也相应提高20%左右，其适口性和奶牛的采食速度也能得到明显改善和提高，总营养价值可提高1倍，达到0.4~0.5个饲料单位，电即l千克氨化秸秆相当于0.4~0.5千克燕麦的营养价值。正是由于秸秆氢化具有上述优点，故此项技术在国内外反刍家畜养殖业中得以迅速推广。秸秆氨化处理因采用的氮源不同而又有以下3种不同的方法。
1、液氨氨化法。将切碎的秸秆喷入适量水分，使其含水量达到15%~20%，混匀堆垛。在长轴的中心埋入一根带孔的硬塑料管，以便通氨。用塑料薄膜覆盖严密，然后按秸秆重量的 3%通入无水氨。处理结束，抽出塑料管，堵严。密封的时间以环境温度的不同而异，气温为20℃时为2~4周。揭封后晒干，氨味自行消失，然后粉碎饲喂。
2、尿素氨化法。由于秸秆中有尿素酶，将尿素或碳酸氢铵与秸秆贮存在一定温度和湿度下，能分解出氨。所以使用尿素或碳酸氢铵处理秸秆，均能获得近似氨的效果。方法是按秸秆重量的3%加进尿素。将5千克尿素溶解在60升水中均匀地喷洒到100千克秸秆上，逐层堆放，用塑料膜覆盖。也可利用地窖进行氢化处理切碎了的农作物秸秆，具体方法同液氨处理，只是时间稍长一些。在尿素短缺的地方，用碳酸氢铵也可进行秸秆氨化处理，方法与尿素氨化法相同。只是由于碳酸氢铵含氮量较低，为17%，其用量须酌情增加。
3、氨水氨化法。预先准备好装秸秆原料的容器（窖、池或塔等），将切短的秸秆边往容器中装填，边按秸秆重1：1的比饲往容器中均匀喷洒3%浓度的氨水（浓度为5%时，每100千克干秸秆加氨水41升）。装满容器后用塑料薄膜覆盖，封严，在20℃左右气温条件下密封2~3周后开启（夏季约需1周，冬季则要4~8周），将秸秆取出后晒干即可饲喂。
实践证明，液氨氨化法和尿素氨化法处理秸秆效果最好，氨水和碳酸氢铵处理的效果稍差。用液氨氨化效果虽然好，但必须使用特殊的高压容器（氨瓶、氨罐、氨槽车等），从而增加了生产成本，也增加了操作的危险性。相比之下，尿素氨化效果好，操作简单、安全，也无需任何特殊设备，适合广大奶牛养殖户采用。
