物理脱毒 剔除发霉或破损的籽粒，脱去含毒素较多的籽粒外皮或胚芽，或用清水淘洗，或通过日晒、辐射、加热等方法以减少毒素含量或毒性。
化学脱毒 某些霉菌毒素可被部分的化学药物破坏降解，如通常用碱水洗涤发霉的籽粒，用氨水可降解一部分黄曲霉毒素等，但不同的化学物质往往只对某种毒素有效而对其它毒素不能降解。
生物脱毒 主要有酶解法和微生物发酵法，此类方法同样仅对某种毒素有一定作用，而且酶不耐热，在饲料加工过程容易失活，而微生物发酵法的作用缓慢。
其它脱毒法 在饲料中添加益生素以保持肠道菌群平衡，增强机体的免疫力以减轻毒素的危害。也有在饲料中添加抗氧化剂、含硫氨基酸、维生素和微量元素等，以减轻霉菌毒素的有害作用，它们对毒素没有特异性。
