金针菇采用铝塑复合袋包装，不仅能延长保质期，而且方便运输、携带，提高其附加值。
一、分级 包装前，要将新鲜金针菇柄基部的褐色段剪去，剔除畸形、带病虫斑点和大小不均的菇体。再按下述标准分级。一级：柄长大于12厘米，盖径1.5厘米，色略黄白；二级：柄长10~12厘米，盖径1~1.5厘米，色深黄；等外品：柄长10厘米以下，菇盖小，或基根粗老、色深。选分时要注意避免将金针菇与铁、铜质器皿接触，以防色泽受到影响。
二、漂洗 将新鲜金针菇放入浓度为0.05%的焦亚硫酸钠液或0.5%食盐溶液中清洗2次，然后用流水冲洗1~2遍，去除残留污垢。
三、软化、护色 在干净水中加入0.5%的柠檬酸，将液温预热至90℃左右后，放入金针菇浸泡3~5分钟。这样既可使其组织疏松，便于包装，又能破坏其酶的活性，稳定金针菇的色泽。然后捞出，用清水冲洗后沥干。
四、装袋、灌汤汁 按每50~100克烫漂过的金针菇作为一束装入铝塑复合袋，灌入占总重量5%~10%的汤汁。汤汁的配制方法是：在10公斤水中加入精盐250克煮沸，再拌入柠檬酸50克、味精10克、山梨酸钠防腐剂5克，用纱布过滤后即得汤汁。
五、密封、杀菌 将灌好汤汁的复合袋进行热封口，袋口密封宽度一般不得小于6毫米。将封好的复合袋进行蒸汽杀菌，蒸汽温度控制在110~115℃，时间10~15分钟。杀菌完毕后迅速放冷水淋袋。当袋温降至40~50℃时，用布揩干袋表面的水分，搁置5~7天后检验，剔下膨胀袋，合格袋贴商标入库.
