有消热解毒、抗菌（如大肠杆菌、痢疾杆菌、肺炎双球菌、流感病毒等）作用。对皮肤真菌、螺旋体及某些原虫也有抑制作用。可治疗细菌性痢疾、急性胃肠炎、仔猪白痢、消化不良、腹泻等。常与黄柏、黄芩配合内服。煎剂或散剂，内服，牛、马20.0~30.0克，猪、羊5~10克，家禽0.3~0.6克，兔0.4~0.7克。2毫升的硫酸黄连素针含20毫克黄连，相当于生药50毫克。肌肉注射，牛、马0.15~0.4克，猪、羊0.05~0.1克。
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