1．萌发菌的种类
现已报道的天麻种子萌发菌均属口蘑科、小菇属的4种真菌，它们的名称是：一是紫萁小菇；二是兰花小菇；三是石斛小菇；四是开唇兰小菇。1999年，专家分离、培养出另一类天麻种子萌发的真菌，为多孔科的大白栓菌。此菌在较高温季节生产和应用要优于上述四种菌类。
2．萌发菌的制作技术
①采取紫萁小菇、石斛小菇、大白栓菌等子实体，用子实体的组织或孢子分离法获得菌种。萌发菌的孢子分离法与蜜环菌种的孢子分离法完全相同。
②用天麻种子形成的原球茎作分离材料。但从原球茎上分离获得的菌种，一定要进行生产试验后才能用于生产。这是因为帮助天麻种子萌发的真菌，现已知道不只是一属或一科的几个种类，而是多个属、科的多个种类。而且有些种类真菌的菌丝体对促进天麻种子萌发的效果较差。所以，建议要从科研单位或正规的菌种厂家购买萌发菌母种或原种用于扩大生产。
3.栽培种配方
①将树叶粉碎后配制。
②用完整的树叶配制的。无论是用碎叶，还是整叶，均要将其放入清水中浸泡3～4小时后，捞出沥去浮水，再撒入麸皮20％，石膏1％，蔗糖1％。拌和均匀后即可装瓶或塑料袋、灭菌、接种。也有用锯木屑、棉籽壳配制萌发菌栽培种的。
