中药材的种类很多，有种子类、花类、果实类、皮类、全草类等，每类药材的加工都不一样。
种子类药材的加工一般果实采收后直接晒干、脱粒、收集种子。有些药材要去种皮或果皮，如薏苡、决明子等。有些要击碎果核，取出种仁供药用，如李仁、酸枣仁等。有些则要蒸，以破坏药材易变质变色的酵素，如五味子、女贞子等。
花类药材的加工为了保持花类药材颜色鲜艳、花朵完整，采后应放置在通风处摊开阴干或在低温下迅速烘干，以避免有效成分的散失，保持浓郁的香气。如红花、芫花、金银花、玫瑰花、月季花等。极少数种类则需先蒸后再进行干燥，如杭白菊等。
果实类药材的加工一般果实类药材采收后直接晒干或烘干即可。但果实大又不易干透的药材，如佛手、酸橙、木瓜等应先切开后干燥；以果肉或果皮入药的药材，如栝楼、陈皮、山茱萸等，应先去除瓤、核或剥皮后干燥；此外，有极少数药材如乌梅等还需经烘烤、烟熏等方法加工。
皮类药材的加工一般采后趁鲜切成片或块，再晒干即成。但有些种类在采收后应趁鲜刮去外层的栓皮，再进行干燥，如丹皮、椿根皮、黄柏皮等；有些树皮类药材采后应先用沸水略烫后，加码叠放，使其“发汗”，待内皮层变成紧褐色时，再蒸软刮去栓皮，然后切成丝、片或卷成筒，再进行干燥，如肉桂、厚朴、杜仲等。
全草和叶类药材的加工采收后直接放在通风处阴干或晾干，尤其是含芳香挥发油类成分的药材，如薄荷、荆芥、藿香等忌晒，以避免有效成分损失；有些全草类药材在未干透前就应扎成小捆，再晾至全干，避免散失，如紫苏、薄荷、断血流等。一些含水量较高的肉质叶类，如马齿苋、垂盆草等应先用沸水略烫后再进行干燥。
根及地下茎类药材的加工这类药材采收后，一般须先洗净泥土，除去须根、芦头和残留枝叶等，再进行大小分级，趁鲜切成片、块或段，然后晒干或烘干即成，如白芷、丹参、牛膝、前胡、射干等；一些肉质性、含水量较高的块根、鳞茎类药材，如天冬、百部、薤白等，应先用沸水稍烫一下，再切成片晒干或烘干；对于质坚难以干燥的粗大根茎类药材，如玄参、葛根等应趁鲜切片，再进行干燥；对于干燥后难以去皮的药材，如丹皮、桔梗、半夏、芍药等应趁鲜刮去栓皮；对那些含淀粉、浆汁足的药材，如天麻、地黄、玉竹、黄精、何首乌等应趁鲜蒸制，然后切片晒干。有些种类如北沙参、明党参等应先放入沸水中略烫一下，再进行刮皮、洗净、干燥；此外，如丹参、玄参、白芍等药材，先要经沸水煮，再经反复“发汗”才能完全干燥。还有些种类的药材，如山药、贝母等须用硫磺熏蒸才能较快干燥，保持色泽洁白，粉性足，且能消毒、杀虫、防毒，有利于药材的贮藏。
