症状主要为害根茎部和根部。发病初期病部呈褐色至黑褐色，逐渐腐烂，后期外皮脱落，只剩下木质部，剖开病茎可见维管束褐变。湿度大时病部长出一层白色至粉红色菌丝状物。地上部叶片发黄或枝条萎缩，严重的枝条或全株枯死。
病原Fusariumsolani（Martl）Sacc.称茄类镰孢，属半知菌亚门真菌。病原菌产生大小两种类型的分生孢子。大型分生孢子无色，镰刀状，多胞具隔；小型分生孢子无色，卵圆形，单胞。此外有些地区称立枯丝核菌也可引起类似的症状。
传播途径和发病条件病菌留在土壤中越冬，翌年条件适宜时，随时均可侵入根部或根茎部引起发病，一般4―6月中、下旬开始发生，7―8月扩展。地势低洼积水、土壤粘重、耕作粗放的杞园易发病。多雨年份、光照不足、种植过密、修剪不当发病重。
防治方法（1）新建杞园要选择在地势高燥的沙壤上，严禁栽植有病种苗。（2）发现病株及时挖除，补栽健株，并在病穴施入石灰消毒，必要时可换入新土。（3）提倡施用日本酵素菌沤制的堆肥和腐熟有机肥。（4）发病初期喷淋50%甲基硫菌灵可湿性粉剂600倍液或浇灌45%代森铵水剂500倍液、20%甲基立枯磷乳油1000倍液。经1个半月可康复。此外，浇灌25%多菌灵可湿性粉剂或65%代森锌可湿性粉剂400倍液，2个月后也可康复。（5）立枯丝核菌引起根腐病的地区或田块，可试用植物生长调节剂――移栽灵混剂。
