枸杞发枝力强，生长茂盛，具有每年两次结果的特性，其长势快，5年左右可进入盛期，为使其结实面大，产量高，春、夏、秋三季都要修剪。为了合理利用光能，管理采摘方便，树高控制在1.5—2米，树冠平均直径1.6米。
一、 幼树的整形：春季定植后，当苗高0.6—1.3米时，在距地面60厘米处将顶芽剪掉，称之为“剪顶定干”。后选留健壮且分布均匀的侧枝数条，作为骨干枝，逐步培养三层主枝。
1、培养第一层主枝：定干后，在剪口下10—20厘米范围内发生的枝条中，选3—5个分布均匀的枝条，留作培养第一层树干的主枝，当年夏秋间，将各主枝留10—20厘米短截。第二年，对上年主枝萌发的新侧枝留20—30厘米剪顶，并适当疏剪弱枝。第三年，对新发生的侧枝不再短截，让其充实，扩大第一层冠。
2、培养第二层主枝：在定植后的第二年，从主干上端选留一个直立的徒长枝，作为延伸的主干，在距地面120厘米处去顶。在顶部发出的侧枝中，再选留3—5个作第二层树冠的主枝。
3、培养第三层主枝：在定植后的第三年，从第二层树冠的中心选留一个直立的徒长枝，作为延伸的主干，在距地面160厘米处剪去顶部，在顶部发出的新侧枝中，再选留4—5个作第三层树冠的主枝。
二、成年树疏枝：首先要剪去死枝、病虫枝、伤枝、针刺枝和横穿枝，而后疏剪过密的结果枝。疏剪结果枝时，先去阴枝、背下枝、细弱枝；后去背上枝、中间枝；如果还密，再疏两侧枝，剪后使果枝间距离为5～6厘米，而且都是生长充实，结果力强的白条枝。
三、 处理徒长枝：生长在骨干枝下垂处的徒长枝，留作骨干枝的延长枝，并适当短截，使枝势和延伸方向稳定；徒长枝附近有空间的，适当短截，培养成结果枝组，扩大树冠，增加结果面积；无利用价值的徒长枝，从基部剪掉。
四、更新复壮结果枝组：枸杞结果枝组结2年果后多弯曲下垂，结果能力降低，对这种结果枝组，留3～5厘米短截，春季发芽后，选一生长方向位置合适而且健壮的芽，通过摘心培养成新的结果枝组。
五、更新培养结果枝：枸杞结果枝因品种不同结果能力不同，有的能连续结两季果，有的只能结一季果，或只在顶端结小而少的果。结果弱的果枝特征是枝条呈灰褐色，极短枝明显。对这种果枝必须及时短截更新。一般从果枝弯曲下垂处剪去，粗壮的短剪1/2，弱的短剪2/3，过弱的只留5～6厘米短截，短截程度宁轻勿重。
