家畜怀孕后，如果临床用药不慎，往往导致怀孕失败，妊娠中断。所以，孕畜用药应注意把握以下几点：首先，孕畜患病，非用药不可时，务必及时用药医治。要改变那种凡孕畜用药都有害的错误观点，不可一味注重胚胎安全而延误孕畜治疗。其次，孕畜患病用药医治时，一切从保胎原则出发，首先要考虑所用药物对胎儿有无直接或间接的危害；其次要考虑所用药物对母体有无毒副作用。第三，怀孕期用药要特别慎重，非用药不可时，可选用不引起死胎和致发畸胎的药物。第四，孕畜用药剂量不宜过大，时间不宜过长，以免蓄积作用祸及胎儿。第五，孕畜慎用全麻药、泻药、攻下药、驱虫药。禁用有直接和间接影响性机能的药物，如前列腺素、肾上腺皮质素、促肾上腺皮质激素、雌（雄）激素；又如缩宫药物的催产素、垂体后叶素、麦角制剂、氨甲酰胆碱、毛果芸香碱，还有中草药的桃仁、红花、乌头等。第六，母畜患病未愈前不宜输精配种，以免影响受精率和早期胚胎发育。
