鸡舍的彻底消毒对防止疾病传播起到至关重要的作用。但是，目前多数鸡场，由于鸡舍条件有限，再加上不重视或程序不当，致使一些疾病传播，严重影响到养鸡场经济效益和社会效益。为此，特提出如下消毒程序，以供广大养鸡户参考。消毒程序和步骤老鸡淘汰之后应立即清除鸡舍内全部用具、垫料和灰尘；用高压水泵冲刷地面、墙壁、天花板及门窗；鸡舍干燥2～3天；用火焰喷灯对地面及墙壁进行火焰消毒；用3%火碱溶液消毒1次；隔1～2天再用100公斤水对10公斤火碱和10公斤生石灰配成的药液，喷雾消毒1次，至墙壁喷白为止；最后按每立方米空间用福尔马林42毫升，高锰酸钾21克熏蒸消毒，闭密门窗24小时，第二天再通风。若急需进鸡，可用等量的25%浓度的氨水加以中和。空舍7天后使用。注意事项用过的料桶、水槽等用3%来苏尔或者1%火碱浸泡24小时，然后用清水冲洗干净，放在阳光下晒2～3天，或在熏蒸前将其移入鸡舍，一起消毒。熏蒸消毒前要将养鸡所用的工具（包括饲养员的被褥和工作服）等进行更换，最好洗刷干净，消毒之后一起进行熏蒸消毒。彻底消毒鸡舍污水池，并对院内表层土进行更换，最好进行一次消毒。彻底消灭苍蝇及老鼠，窗户要钉铁网，防止老鼠、麻雀飞入。种鸡场饲料袋最好一批种鸡一次更新，或将用过的料袋放入来苏尔水中浸泡24小时，再用清水冲洗，晾干后再熏蒸，定点使用效果更好。种鸡淘汰与新鸡入舍，间隔时间不能少于1个月。鸡舍一旦消毒完毕，任何人不能随意进入。有条件的鸡场在熏蒸消毒前将灯线或灯泡更换新的，以防消毒不严或漏电。还要注意通风孔及风扇处的消毒清洗，对天棚上面的灰尘也要冲洗消毒。
