发酵床养猪除臭，其奥妙可从以下几个方面分析：
一、减少污染源。氮是排泄物中造成环境污染的主要元素之一。排泄物中氮一般占干物质的２．０％～６．０％（其中３３％在粪便中，６７％在尿中）。畜禽主要通过日粮摄入蛋白质（蛋白质平均含氮１６％）态等氮元素，经过消化吸收，被动物机体沉积利用约３５％，其余约６５％排出体外。猪粪尿中的NH3、H2S就主要是猪摄入体内的蛋白质未被吸收或吸收不彻底所产生的，提高蛋白质的利用率就能减少恶臭气体的排放。发酵床养猪就能因为猪的拱食而使得从粪便中排出的蛋白质能得到进一步的循环利用，进而提高蛋白质的利用率，减少了污染源，也即污染物的排出已被“减量化”了。
二、物理除臭。所谓物理法除臭就是指将产生恶臭气味的的气体吸附在固体或液体介质表面，使其不易散发到空气中。发酵床的垫料是由50公分左右的锯末（木屑或稻壳等）组成，有恶臭成分的气体通过木屑粒子间时，部分恶臭成分被木屑吸收或被木屑间的水分及木屑固有水分溶解，减缓了恶臭成分气体释放的速度和释放的量，从一定程度上控制了臭味的散发。
三、化学除臭。化学除臭就是利用特定的一些化学反应将有臭味的有害气体转变成无毒无害的物质。通过物理吸附使得恶臭气体与发酵床垫料气－液接触，使气相臭味成分转移至液相，并借发酵床发酵产生的物质与臭味成分的中和、氧化或其它反应去除臭味物质，包括有机硫化物、含氮化合物、有机酸及少数含氧碳氢化合物等。不过这方法只能把臭味分子转成盐类以利于吸收，须再用其它方法把臭味成分破坏或回收。
四、生物除臭。生物除臭是发酵床发酵剂养猪中没有臭味的最重要原因，主要在两个方面发挥着重要作用。①发酵剂每克本身就含有超过1.5亿有益功能活性菌，在发酵开始后有益微生物更是呈几何级大量快速繁殖，在此过程中正好将猪排泄出的粪尿以及吸附在木屑上的铵硫等恶臭化合物消化吸收，转变成可供猪拱食的蛋白质和微量元素。随着发酵过程的不断进行，功能微生物的快速繁殖会越来越彻底地将恶臭物质消化吸收。②猪有拱食的习惯，这一习惯在发酵床养猪过程中正好能被充分利用。发酵剂中的有益微生物随着猪的拱食而进入猪的消化道。肠胃中的有益微生物不但能抑制部分病原菌活动，预防疾病，而且还能抑制有害菌的活动，例如抑制威尔士菌活动，这样就阻止了对蛋白质的异状分解，从而减少了氨和吲哚的产生。这几种恶臭物质减少了，猪粪的臭味自然就减轻了。另外，有益微生物中蛋白酶、脂肪酶和淀粉酶酶活较高，能增强对蛋白质、脂肪等物质的分解，不仅能提高饲料的利用率和吸收率，促进畜禽的生长，而且也能减少恶臭物质的产生。
