由于葡萄球菌广泛存在于自然环境中，因此，防治本病的关键是做好平时的预防工作。
消除使鸡产生外伤的因素，如保持笼、网、禽舍的光滑平整，保证垫料的质量，减少鸡爪垫的损伤；合理调整饲养密度，注意控制鸡舍温度、湿度和通风；搞好环境卫生，定期用0.3％过氧乙酸喷雾消毒禽舍；注意对蛋壳表面的消毒及对孵化室空气、地面及孵化器的消毒工作，防止孵化过程中污染；尽量避免或减轻应激因素，加强禽群的饲养管理，保证饮水和饲料的清洁。
常发地区或药物治疗效果很差甚至无效的地区，可采用菌苗接种来控制本病。国内研制的鸡葡萄球菌病多价氢氧化铝灭活菌苗，可有效地预防本病发生。 金黄色葡萄球菌对药物极易产生抗药性，由于抗药菌株不断增多，治疗本病必须做药敏试验，选择有效药物全群给药。
实践证明，庆大霉素、卡那霉素、氟哌酸、恩诺沙星、新霉素等均有不同的治疗效果，肌注或内服敏感药物，或者肌注、内服并用。治疗中首先选择口服易吸收的药物，当发病后立即全群投药，对病情严重的，可经肌肉注射给药。
