鸡球虫生活史，包括3个发育阶段。
1、在宿主体内进行裂殖增值阶段：鸡吞食了孢子化卵囊后，由于肌胃的机械作用，卵囊壁被破坏，释放出孢子囊，孢子囊在肠消化液的作用下，释放出子孢子，子孢子进入肠粘膜上皮细胞，进行裂殖发育，生成许多裂殖体，裂殖体增殖若干代后，开始转入有性的配子生殖。
2、配子生殖阶段：裂殖体增殖进行若干代后，开始进行有性的配子生殖，大、小配子结合为合子，合子外壁增厚成为卵囊，随粪便排出体外。
3、在外界环境中完成的孢子增值阶段：在鸡粪中见到的球虫叫卵囊，是球虫的一个发育阶段，用显微镜检查，卵囊呈无色或黄色，圆形或椭圆形，有两层轮廓的卵囊壁。随鸡粪新排到外界的卵囊，内含一团球形原生质球。卵囊在合适的温度、湿度条件下进行孢子增值，形成含有4个孢子囊，每个孢子囊内含有2个子孢子的感染性卵囊。鸡吞食了这样的卵囊，就会被感染。若球虫卵囊由于温度、湿度的原因未能孢子化，鸡吃了这样的卵囊也不会被感染。
鸡球虫是专性细胞内寄生虫，球虫进行一轮发育需要7天，体内6天，体外1天。球虫疫苗，挑选早熟株，体内3—4天完成发育形成卵囊，即裂殖增殖代次减少，大大减轻了对肠道粘膜上皮的损害。各种球虫之间交叉免疫力很弱。各地区球虫种类的分布也有差异，柔嫩、堆型、巨型艾美尔球虫一般比较常见。柔嫩艾美尔球虫（盲肠球虫）主要侵害15—60日龄的雏鸡；毒害艾美尔球虫（小肠球虫）主要侵害8—20周龄育成鸡、青年鸡；堆型和巨型艾美尔球虫主要侵害青年鸡、产蛋鸡。其他则不常发生或很轻微（布氏、和缓、变位、早熟艾美尔球虫）。
