1．绿霉病
又叫绿僵霉菌病，是人工养殖蜈蚣的主要疾病。在6月中旬到8月底，由于气温高，湿度大，以及食物发生霉变，蜈蚣容易受到病菌的感染而得此病。受感染的蜈蚣早期主要是在关节的皮肤上出现绿色的小斑点，以后逐步扩大；继而体表失去光泽，腹部下面出现黑点，食欲减退，行动呆滞，最终因拒绝取食消瘦而死亡。发生该病的主要原因是饲养环境的湿度过大，或池内残存的食物腐烂霉变所致。
防治办法：（1）清除霉变的食物，喂新鲜的活食，保持好养殖池内的卫生，并进行消毒灭菌。（2）调节养殖池内的温湿度，保持通风散湿。（3）对发病的蜈蚣可用青霉素0.25克加水1千克喷雾消毒或加水饮用，直到病愈。
2．腹胀病
蜈蚣多在秋后阴雨低温时期患此病，多因多食和低温所致，病蜈蚣早期头部呈紫红色，毒钩全张，不食或少食，腹部胀大、行动迟缓、发病1周左右后死亡。
防治方法：用食母生1克加水500克拌匀，让期吸吮，并提高饲养温度。隔日喂食，直至病愈。
3．脱壳病
由于蜈蚣栖息场所过于潮湿，使真菌在躯体寄生所引起。初期表现为不安躁动，来回爬动，后期再再为无力，行动滞缓，最终因不食不动而死亡。
防治方法：土霉素0.25克，食母生0.6克，钙片1克，共研成细末加400克饲料拌匀，连喂多日，直至病愈。
4．蚁害
正在蜕皮或产卵孵化期的蜈蚣抵抗能力弱，此时进入后会群起而攻之。致使脱皮时的蜈蚣被咬死，或使孵化中的雌蜈蚣弃卵而逃。
防治方法：（1）在养殖池周围挖一圈围沟，注入水，可有效防止蚂蚁进入。（2）可用骨头、糖类、水果或其它甜食把蚂蚁诱引后用开水烫死。
5．流产
孕蜈蚣多因为受到干扰、翻动、嘈杂或异物的直接刺激所致，因此在孕期应保持安静，更不能经常翻动。此外，还要防止老鼠吞食成虫、幼体和卵而造成危害。
