1、大量地滥用药物会引发肝肾综合症。肝肾具有解毒、排毒功能，因长期大量地滥用药物，会使肝肾不堪负重，造成机体肝肾损伤，机能下降，且由于肝肾是实质性器官，它的损伤又直接影响了一旦发病在治疗时的药物转化吸收，使疾病更难治愈。
2、长期滥用化学类的抗病毒药物使病毒产生耐药性变异株。化学类抗病毒药物大多只能抑制而不能杀死病毒，长期滥用会使多种病毒对现有的抗病毒药物产生耐药性变异株，甚至还会出现依赖药物的变异，造成常用抗病毒药物防治疫病的效果不佳或根本无效。
3、大量的抗菌素、抗病毒类药物长期作用使机体免疫功能下降。大量的抗菌素、抗病毒类药物长期作用于机体的组织器官，会使淋巴细胞的抗体合成活动受到抑制，导致机体自身免疫功能下降，容易受到多种病原微生物的侵害而发病。
4、长期滥用抗菌素类药物导致病原菌产生耐药性。长期滥用抗菌素类药物，特别是磺胺类药物使病原菌敏感性降低而产生耐药性，并且可以使多种病原菌产生耐药性和使一种病原菌产生多种耐药性，一旦耐药病原菌引发疾病就很难治愈。
