黑雁到达繁殖地后就开始营巢,通常4对~5对在一起,成群营巢在陡峭的河岸附近、富有杂草和灌丛的溪流和峡谷,以及斜坡地上的凹洼处。
黑雁巢筑于较为开阔的、地势较高的干燥地方,没有任何隐蔽物,极为暴露,常常很远就能看见,有时还与鸥和猛禽等捕食鸟类的巢紧挨在一起,因此巢的损失率很大。巢由干草等构成,里面铺垫一些绒羽。
黑雁每窝产卵3枚~8枚,偶尔为9枚。通常在6月中旬开始产卵,卵的颜色为橄榄绿色和淡黄白色,孵卵由雌鸟单独承担,雄鸟在雌鸟产卵和孵卵期间均在巢的附近担任警戒任务。当雌鸟离巢觅食时,便用巢边的绒羽和草将巢掩盖起来。