1.接种前鸡带强毒。接种时鸡群内已潜伏了强毒病原微生物，只是未表现明显的临床症状，或接种人员和接种用具带有强毒微生物。2.接种时间不适宜。农户难以确定接种疫苗的准确时间，免疫效果也就存在不确切的可能性。3.疫苗使用剂量过大。例如，雏鸡大剂量使用新城疫Ⅰ系疫苗会导致扭头、转圈等神经症状。大剂量使用传染性喉气管炎疫苗会出现流泪、喉头出血等传染性喉气管炎症状。4.接种后引起不良反应。例如鸡新城疫Ⅰ系疫苗、鸡传染性支气管炎疫苗的接种，可能造成本来不明显的败血支原体病暴发。因此，当鸡群有败血支原体潜伏又要进行上述疫苗接种时，应考虑提前给免疫接种的鸡服用药物，以便减轻或防止潜伏疾病暴发。5.疫苗使用技术错误，从而影响了免疫效果。6.养鸡场往往几种疫苗同时使用，使不同种类疫苗间的相互干扰。
