霉菌毒素是一种有毒真菌，多发生在炎热的雨季，高温高湿为病原的繁殖和滋生提供了最好的场所，家禽食入或吸入病原而感染。1月龄以内尤其是5-9日龄最易感染，常呈爆发性，发病率和死亡率较高。霉菌毒素具有极强的腐蚀性，对消化道的破坏相当严重。能引起口腔溃疡，嗉囊炎症以及病情后期的假膜，溃疡性以及增生性肌腺胃炎，在腺胃与肌胃交界处形成溃疡，肌胃角质膜易剥离，角质膜增厚以及角质膜下形成出血溃疡，肠道脆性增大，肠黏膜脱落、坏死。影响机体对营养物质的消化和吸收，饲料利用率和转化率降低。还能引起法氏囊、胸腺和脾脏等免疫器官萎缩，诱发免疫抑制。常见的霉菌毒素有黄曲霉菌、呕吐霉菌、烟曲霉菌、赭曲霉菌等，对家禽主要造成以下几种危害：
呕吐霉菌霉菌毒素会造成经常性的拉稀，肠道病久治不愈，饲料便频繁发生，采食量大大减少，体重大大下降。
黄曲霉菌霉菌毒素中毒可导致肝脏多灶性肝细胞坏死，肝细胞增生以及发病前期由于充血而呈暗红色，后期由于脂肪聚集呈黄色，但不管发病前期与后期都为橡皮肝的感觉。胆囊黏膜由于胆小管的增生和坏死而发炎，出现胆囊脆性增大的现象。
玉米赤霉烯酮霉菌毒素会造成种鸡产蛋下降、蛋壳质量下降、受精率和孵化率下降，孵化中胚胎死亡多见。
赭曲霉菌霉菌毒素对肾脏的损害表现为肾小管发生变性而阻塞，产生尿酸盐沉积，从而导致痛风症的发生，不明病因腿病增多。
烟曲霉菌可导致眼炎、皮炎、坏死性肉芽皮炎。
