一、一般问题的处理
1. 小动脉出血。手术时用力过猛或摘除卵巢时伤及子宫动脉，引起较严重出血时，应用止血钳止血或结扎血管。
2. 膀胱破裂。手术造成膀胱破裂时，应扩大创口，找出膀胱破裂口，施行全层连续缝合和内翻缝合，并用生理盐水冲洗腹腔后缝合腹膜和皮肤创口。
3. 肠管脱出和肠管破裂。阉割后因创口过大、创口感染或腹压过大造成肠管脱出（包括脱至皮下）时，应及时用生理盐水冲洗后将脱出的肠管送回腹腔，缝合腹膜和皮肤，对肠管脱出（包括脱至皮下）的处理时间越早越好，最好是在阉割后的两天内进行。若肠管脱出时间较长，已造成粘连时，应小心剥离粘连肠管后按上述方法将肠管送回腹腔，并沿创口向腹腔内撒布少量青霉素粉，再缝合腹膜和皮肤。造成肠管破裂时应用连续和内翻缝合法闭合裂口后按上述方法将肠管送回腹腔，然后再缝合腹膜和皮肤。若肠管坏死时应切除坏死部分，用肠管侧壁吻合法缝合肠管后送回腹腔，然后再缝合腹膜和皮肤。术后，给仔猪注射抗菌消炎药物，头几天还必须输液补体，直到仔猪能自行吃食为止。
二、异常问题的处理
1. 卵巢与骨盆腔粘连。极个别仔猪出现卵巢（多为一侧）与骨盆腔粘连的情况，不易拉出，应扩创后食指伸入探摸卵巢，慢慢地剥离后再勾出。这时创口肯定过大，肠管易随术者的手指而脱出，将脱出的肠管送回腹腔后，再缝合腹膜和皮肤即可。
2. 子宫角被系膜包裹。有极少数仔猪子宫角反被系膜包裹起来，不易自动从创口内涌出，应用小挑花刀刀柄轻轻搅动。若包裹的系膜已涌出创口，并可见子宫角在内，这时可用右手拇指指甲与食指指甲撕裂系膜，即可露出子宫角，并尽快用左手拇指和食指将子宫角理出来。如果子宫角还不涌出，术者可用手拉住仔猪的尾巴让其走动几步，待子宫角散开后再施行手术。
3. 阴阳仔猪的阉割。有极少数仔猪外表像母猪，但外阴不正常，阴蒂较大，阉割时可见到异常“子宫角”（比正常的子宫粗大），但“子宫角”连接的是两个睾丸。遇到这种情况，可与阉割小公猪一样操作，方法是掐断睾丸或结扎后连同子宫体全部切除，再缝合创口即可；另有极少数仔猪外表像母猪，没有阴门和阴蒂，也没有睾丸，此时要吩咐畜主注意观察其排尿情况，如果排尿像母猪一样，再施行“小挑花”阉割术。
