鸭是卵生动物，种蛋从贮藏室取出来后，要在孵化室内自然预热，待蛋表温度达到室温后即进行码盘入孵，码盘位置与贮存时一致。另外，孵化机事先须清洗、消毒、调试并要预热。
温度和湿度
如果把孵化机传感器放在孵化机内蛋盘外面的空间里，在入孵后第1-7天孵化机空间温度为38.5℃，第8-25天为38℃，第26-28天为37℃，如果把孵化机传感器放在蛋盘里的种蛋上，则自始至终保持蛋温37.8-38℃即可。孵化湿度根据孵化机不同而有区别，电热管直接放在孵化机内加温的老式孵化机，机内风很大，入孵后第1-24天孵化湿度60%，第25-28天为70%。用暖风加热，机内风机较小的孵化机，入孵后第1-24天孵化湿度50%，第25-28天为60%。
翻蛋
在入孵后第1-26天，每隔2-3小时要翻蛋一次，每日翻蛋8-12次，翻转角度为90℃，以使胚胎各部分受热均匀，防止胚胎黏壳。如果孵化机内各处温差±0.5℃，则每日要调盘一次，即上下蛋盘对调，蛋盘四周与中央对调。
照蛋
第1次照蛋在孵化后第7天进行，通过照蛋，捡出无精蛋和死胚蛋。受精蛋胚胎发育正常，血管呈放射状分布，颜色鲜艳发红；死胚蛋颜色较浅，内有不规则的血环、血弧，无放射状血管。无精蛋发亮无血管网，只能看到蛋黄的影子。第2次照蛋在入孵后第26天进行，以删除死胚蛋，活的正常胚蛋移入出雏盘和出雏器。活胚蛋呈黑红色、气室倾斜、边界弯曲、周围有粗大的血管；死胚蛋气室周围看不到暗红色的血管，边缘模糊，有的蛋颜色较浅，小头发亮。在孵化过程不定期地抽检胚蛋，以便掌握胚胎发育情况，并据此采取相应措施。
落盘与出雏
鸭种蛋孵化至26天，应将活的胚蛋落盘。落盘后要按种蛋孵化的温度与湿度要求来控制温度和湿度，即较前一孵化阶段，温度适当降低，而湿度适当增加，以利出雏。为保证有足够湿度，应适当增加水盘数量，保持水盘内的清洁，以利水分蒸发。鸭种蛋孵化至第27.5天即开始出雏，满29天出雏完毕，鸭雏出壳后，在出雏器内要停留至羽毛干透，而后取出，放入育雏室或箱中。捡雏过早，幼雏羽毛未干，对环境适应性差；捡雏过晚，幼雏羽毛干后四处活动，鸭雏可能自行爬出，掉入水盘淹死。出雏期间应尽量少开照明灯，只在捡雏时开灯，以免幼雏爬行时损伤关节。一般2小时捡雏一次。
