1.早预防：鉴于仔兔的球虫病发生与母兔关系密切，即仔兔在断奶前即从母兔感染了球虫，成为球虫携带者。因此，预防球虫病应从母兔抓起。降低母兔的带虫率是降低仔兔发病率的有效措施。当然，加强产仔后的防疫更为重要。母兔在产前，应彻底消毒笼具，尤其是踏板、产仔箱和草垫。仔兔哺乳前，应将母兔的腹部和乳房用清水洗涤并用药物消毒（医用碘酊或爱迪福、威力碘等碘制剂涂抹乳头）；当然，有条件的兔场，应有效地控制兔舍环境湿度，加强消毒、粪便处理和蚊蝇杀灭工作。
2.勤检测：鉴于球虫病发生有全年化的趋势，给预防工作带来极大的难度。为了控制防治成本，应对球虫卵囊进行及时检测，根据其发展情况采取必要的防疫措施。
3.活用药：鉴于家兔球虫病的疫苗预防技术尚未成熟，在预防工作中应首先选择药物预防。应制定有效的预防方案。比如穿梭用药：即几种特效药物按照一定程序交替使用，以防止产生耐药性；复合用药：即采用有协同作用的两种或两种以上的药物，同时使用，达到双重阻断。比如磺胺甲氧嗪配合TMP已被证明为有效的组合；避免长期使用一种或少数几种药物。
4.选用新药与使用复合中药：当发现用常规药物预防效果不理想的时候，可换一种新药试试。如使用球净1号，无论是预防还是治疗，其效果均优于传统药物。
5.严禁滥用药物：生产中有些兔场在防治球虫病时存有“有病乱投医”和用药无章法的现象。比如，用药不当产生大量的马杜拉霉素中毒现象，就说明了这个问题。此外，长期使用磺胺类药物，对于家兔的机体产生不良影响，也降低家兔的生产效率。
【疾病治疗】
1.对发病家兔进行隔离，用沸水对兔笼、饲糟、水槽进行冲洗和用双链委胺盐对周围环境进行消毒。
2.选用中牧股份成都药械厂生产的复方磺胺间甲氧嘧啶钠粉（球菌清）按2.5克/千克混饲，连用5天，同时每天使用水溶性复合维生素粉，病兔用药2天后症状即开始缓解，5天后大部分病兔治愈。
3.对与顽固性球虫病应采用球菌清、氨丙啉联合用药，一般3天后治愈。
