目前蟹苗运输一般彩干法运输，主要应掌握好湿度与温度并适当通风，通常用特制的蟹苗箱，或类似的泡沫箱，苗箱长约40-60cm，宽30-40cm，高8-12cm，箱框四周各挖一窗孔，底部用窗纱钉牢，上方加盖，可相互叠放。首先将苗箱在水中泡透，然后在箱底铺些水草。长途运输一般每箱装500g苗，短途或气温低可稍多装，最好夜晚起运，避免曝晒。气温超过25℃时，则应在箱内加冰袋。用汽车运输时，应尽量避免过大风速，保持箱内一定湿度，视具体情况适量喷水，若用冷藏车或收音机运输则途中不需喷水，运输时应即捕即运。正常情况下运输在20小时内，成活率在95%以上，蟹苗抵达塘口后，应将苗箱搬出车外，适量喷水，然后将苗箱端入水中，倾斜让苗自然游走即可。
