亲鱼在运输前1-2天应停止喂食，以减少运输中的排泄物。运输时间以冬季和早春（水温5-10摄氏度）为宜。
现介绍几种常用的运输方法：
1、 大帆皮捆箱运输。 将一块大帆皮置于敞篷汽车上，周围扎紧后装水1/3左右。每尾亲鱼可用亲鱼布夹装入帆皮槽内，也可将亲鱼装入塑料袋后冲氧，然后将其放入捆箱水中。此法装载量大，安全，成活率高，每次可运草鱼、鲢、鳙等亲鱼各20-100尾，鲤亲鱼500-150尾，鲫亲鱼500-1000尾。
2、 塑料袋冲氧运输 一般采用0.1毫米厚的聚乙烯膜制成适合于亲鱼大小的袋子，用双层装运或外面套一只大小相同的布袋。装水量以浸没亲鱼体为宜，也可用七万分之一的巴比妥钠麻醉运输。冲氧后扎紧塑料袋，然后放入硬纸箱中，扎紧后即可进行空运、水运或陆运。若路程超过24小时，可换水冲氧或只冲氧一次。为防止鳊棘刺破塑料袋，可用小胶管将棘套住。也可用1毫米厚的橡皮布代替塑料薄膜制成运输袋，效果很好。新袋在用前需装水浸泡。
3、 帆皮篓运输 水与鱼之比约4:1，篓内周围衬垫塑料海绵以减少撞伤。故此适于短途水、陆运输。
4、活水船运输 亲鱼宜借助亲鱼布夹或塑料袋装好后放入活水船舱中，以减少跳、装致伤。
