第一，消毒药的浓度。浓度是决定消毒液杀菌力的首要因素。没有足够的浓度就不能杀死病毒、细菌。但也不是浓度越高就越好，还要考虑其经济效益和安全性。因此，每种消毒药其使用浓度都有严格规定，使用时一定要按说明去做。
第二，消毒药的剂量。剂量和效果密切相关，无论多强的消毒药，如使用的剂量不够也达不到消毒目的。不能因为消毒液浓度增高就相应的减少用量。如果使用的剂量尚不能湿润被消毒的物体，消毒效力就不会均匀，这只能是不完全的消毒。
第三，消毒药作用的时间。消毒药发挥效力需要一定的时间，因为药物与病原微生物接触而达到杀灭作用需要一定时间，特别是用浸泡方法进行消毒时，一定要有足够的时间才能达到消毒目的。
第四，消毒药所需温度。一般消毒药在温度较高情况下比在温度较低情况下所需时间短，消毒效果好。因为消毒药是温度越高其分子运动越剧烈，与病原微生物接触次数越多，消毒效果越好。但是，有些消毒药如氯制剂和碘制剂，因具有易挥发的特性，高温反而会导致有效成分消失，降低消毒效果。
第五，合理使用多种消毒药。在重复消毒时，如使用两种化学性质不同的消毒药，一定要在第一次使用的消毒药完全干燥，经水冲洗后，再使用另一种消毒药，严禁把两种化学性质不同的消毒药混合使用。
第六，有些消毒药如福尔马林，有强烈的刺激性气味，消毒后要对栏舍充分通风后才能进下一批畜禽。有些消毒药如苛性钠，对人和畜的皮肤有腐蚀性，使用时要注意安全。
