臭氧具有很强的氧化力及杀菌作用，且易分解成为无害之氧气，故食品、环保、水产养殖等行业用于杀菌、除臭、去色等已日见广泛。臭氧在干燥状态的杀菌力较弱，臭氧浓度需达到8-14ppm才能杀灭空气中的细菌。相反在水中臭氧的杀菌力就很强，仅0.04-0.5ppm 浓度，数分钟内即具杀菌效果。故目前
臭氧气体仅用于空气环境杀菌、除臭虫以及如金属、纤维、树脂等不宜入水对象的处理，一般都使用臭氧水。
对臭氧杀菌力的认识是从大肠杆菌开始的，然后延伸到黄色葡萄球菌、肠炎菌、芽孢菌等多种细菌以及脊髓灰质炎病毒等病原性微生物的有效杀灭。水产养殖中一些致病鱼虾的病菌、病毒如鳗弧菌、疖疮病菌、肝状病毒（HIVVR)及腹水性病毒（YAN)等均已有臭氧水有效杀灭的报导。
臭氧杀菌机理是先对细菌细胞破壁，然后病毒损伤、割断其核酸，达到细菌的杀灭效果。由于臭氧对人体也会有一定的伤害，故许从国家都对臭氧对的使用环境规定其安全浓度标准，如美、日、比、德等均为0.1ppm，俄、匈、保、波等均为0.05ppm。为防止出现事故，室内气体使用时最好在夜间无人时，并对其残留臭氧或臭氧合成物需用活性炭滤器消除处理。如国外有一种中央臭氧系统，犹如中央空调一样。 白天生产低浓度臭氧水供水槽中安全处埋，晚上则有嵌入顶棚内的送气口送出臭氧 气体，扩散于室内，并根据是否有人及处理目的调节不同的浓度。有人时为0.01-0.05 ppm,无人时为0.2-0.3ppm,确保安全使用。
使用臭氧应根据对象、目的选择不同的浓度，如杀菌需0.2-0.3ppm,而除臭仅0.01-0.05ppm即可。就是杀菌， 根据处理对象，其臭氧浓度也不同。如同样杀灭大肠菌，制造豆腐时所需臭氧 水浓度为1.0-3.0ppm，而一般仅需0.5-1.0ppm。至于不同的细菌与病毒，选择不同的臭氧 浓度更是十分必要。为此要做许多行业使用基础性的摸索试验以及了解国外已经在这方面做过的基础材料。不适当地片面提高臭氧 处理浓度是有害的，因为过高的浓度会损害人体，故对臭氧浓度的使用控制十分重要，尤其在我国臭氧 应用刚刚起步又迅速铺开的情况下。
臭氧内含20-70%的强氧化剂物质，纯臭氧有极强的氧化力，即使低浓度臭氧则会损害支气管及肺。主要是臭氧会氧化体膜中的不饱和脂肪酸，破坏其比重结合部，进一步破坏卵磷脂（磷脂的一种）。而卵磷脂又是使肺等柔滑扩张的物质。从而使脂乳肿并出血，导致呼吸困难而死。另外长 期暴露于臭氧中也会产生皮肤老年斑现象，严重可并发为癌症。为此臭氧 浓度的检测十分重要，它可确定臭氧浓度是否超标，对于确保处理对象及操作人员的安全都十分重要。在水产养殖水的杀菌处理时，因臭氧水浓度过高及过滤、曝气不够，使强氧化剂致养殖对象死亡的事故发生。国外已开发同时可用臭氧气体与臭氧的浓度计，具有相应测定、设定监视及记录功能，这也是臭氧 积极推广及安全使用的保障。我国臭氧 使用虽刚起步，但应用已发展到多行业中，全国臭氧 技术信息服务网已建立。水产养殖不杀菌及鱼品保鲜，除臭等也多有应用，用于水产养殖场的臭氧 发生器也已面市，但对于使用安全的了解，应采取相应措施及保证的计测手段还相当滞生， 有关标准法规尚在建立之中，故安全检查使用权臭氧 应引起各方的关注，以利于臭氧应用的健康发展。
