头部要检查乌龟的头部时，可用拇指和食指趁其不注意时扣住头的后侧，动作要很迅速，否则一旦让其缩入壳内，要检查就很难了。乌龟若脱皮太多，有可能是皮肤出了问题或者营养不均衡所致。眼睛乌龟的眼睛应该是非常澄清、明亮，若发现有眼脸肿大及较多的泪液形成时，表示眼睛已经出了问题，原因除了眼睛感染、异物、角膜外伤或白内障之外，较常见的是由于维他命A缺乏所引起的结膜炎，尤其是在发育期间最容易发生。耳朵乌龟并没有外耳部，它的耳朵是位于眼睛后方的一个封闭的鼓室。耳朵常发生的问题为脓肿，脓肿有时会造成分泌液由欧斯泰交氏管进入咽喉的后方，结果往往造成附近组织有蜂窝组织炎，或者脓液会变成坚硬且浓缩的情形。鼻乌龟若有呼吸道感染时，常常会发现鼻子前端湿湿的，仔细观察有时还会有泡泡形成，甚至在严重时会有脓样分泌物的产生，这种情况就必须赶紧处理，否则后果将很严重，甚至造成死亡。嘴要检查乌龟的嘴巴往往不是一件容易事。如有必要检查的情况下，不得已只好借助于麻醉的方法。嘴巴打开之后要注意是否有红斑、出血点、坏死、黄疸或干酪样的病，以做为疾病诊断的依据。
