由于臭氧的强氧化性，使得它对水中的各种微生物均具有较好的杀灭效果。伍学洲等在无菌罩(0.7m)通人臭氧，发现经臭氧作用20min和30min时大肠杆菌杀灭率为97.5%和l00%;对金黄色葡萄球菌杀灭率为937%和l00%;对绿脓杆菌的杀灭率为84.6%和89.8%Herbokd等报道20℃条件下将臭氧气体通人流动的水中，当水中臭氧浓度达0.43mg/L时可将大肠杆菌100%杀灭翟发林等报道在34℃±1℃时，浓度为5.50mg/m的臭氧可以在45min内将100ml塑料瓶内滴染的枯草杆菌黑色变种芽孢全部杀灭白希尧等报道，浓度为1.5mg/L 的臭氧溶液仅需lmin即可将试验中的黑曲霉和酵母等真菌100%,杀死，此外，臭氧对原虫及其卵也有较好的杀灭作用。
臭氧净化水质的特点
1、由于臭氧的强氧化性，养殖用淡水或海水中对鱼类危害较大的亚硝酸盐、硫化氢、氨态氰等均可被氧化为无毒的NO、SO、N，等有机物，同时无机物也可被降解生成对生物无毒的物质，从而降低水中的生物耗氧量(BOD)和化学耗氧量(COD)
2、臭氧的强氧化性可对藻类等原生动植物起到迅速的杀灭作用，据孙晓红等报道，取赤潮海水进行30min臭氧处理后，红色赤潮海水完全氧化变为无色透明状，水中的夜光虫全部被杀死呈粉碎状。
3、臭氧可对水中存在的危害水牛生物健康的病原菌起到迅速有效的杀灭作用Kofich等比较了臭氧、CIO，、CI，、氯氮等对微笑隐孢子虫卵的杀灭作用.结果表明lrng/kg的臭氧作用5min可灭活90%的虫囊.而同浓度的CIO，经作用lh，CI，和氯氮均在浓度为80mg/kg且作用90rain后才达到了同样的作用效果。
4、由于臭氧在水中易分解为0，，所以不但可起到杀菌消毒的作用，而且可使水体增氧，直到一举两得的作用
5、臭氧在净化水质的过程中，不会改变水中的原有成分.能保持水中所含的对水生动物有益的矿物质一
6、通过臭氧净化水源的同时，还可起到减少动物肠道内以宿主营养为生的细菌数.降低幼菌营养消耗，而且使有益菌分泌的淀粉酶活性增强，提高了动物对食物营养成分的利用效果，促使动物健康的生长
7、臭氧通过氧化絮凝作用对水质起到净化作用，不会产生二次污染物，消毒过程中产生的氧化物是无毒、无味能生物降解的物质。
