利用冬闲田培育草鱼种，由于水浅，受外界气温影响大，使鱼极易患病，防治不及时，直接影响成活率，因此，应注意病害防治。
一、赤皮病
病历与症状：冬末春初水温低，捕捞等机械原因，造成鱼体表受伤有利于荧光极毛杆菌入侵后潜伏，当气温回升时，迅速发展成急性流行病，引起大量死亡，表现在病鱼体表两侧局部或大部分充血发炎，鳞片脱落，呈不规则的块状红斑，鱼鳍基部充血，鳍条开裂，鱼的上下颌和鳃盖部分充血。
防治：应在投放鱼种前，每亩养鱼田块撒生石灰20-25公斤进行消毒，鱼种下田前用5%的食盐水浸洗3-5分钟，下田后定期用1ppm浓厚度的漂白粉全池泼洒，防治效果极佳。
二、水霉病
病历与症状：机械损伤、冻伤的鱼种，在冬季最易发生水霉菌一类真菌附生，丛生出灰白色棉絮状的菌丝，引起陆续死亡。
防治：鱼种投放前用20ppm高锰酸钾溶液浸洗鱼种，预防效果很好，发病后，用0.04ppm的小苏打加0.04ppm的食盐混合后，全田泼洒或浸洗，治疗效果理想。
三、鱼虱病
病因与症状：主要是冬季鱼种最喜欢集群，鱼虱病极易流行，肉眼可见扁圆形的虫体在鱼体上爬行，或叮咬，使鱼体瘦弱，体质不佳，影响生长。
防治：要定期用90%的晶体敌百虫0.2-0.5ppm浓度泼洒，可全部杀死。
四、口丝虫病
病因与症状：主要在面积小、水质脏的冬闲田，温度8℃-11℃时最易流行发病，由口丝虫寄生而引起的病鱼食欲不佳，靠田边缓慢游动，鱼体发黑，皮肤上形成一层蓝灰色的粘液，能在短期内迅速感染，引起大批死亡。
防治：除搞好田间和鱼种消毒外，对已发病的鱼，可用0.8ppm的硫酸铜全田泼洒进行防治，或每亩水深0.5米的鱼田，用硫酸铜120克、硫酸亚铁50克分别溶解后混匀，再加水，选择在晴天9时或下午4时左右进行全田泼洒，两天后可见效。
