对于海龟疾病的治疗，首先要确定病因、病原，并根据药物实验确定治疗药物，但治疗时间的长短有时因无法确定病原而不能确定。
1、营养障碍 维生素A缺乏可通过眼炎来诊断，当有此症状出现时，可投喂鱼肝油，维生素E缺乏要及时补充维生素E。对于营养障碍，关键在于预防，投喂维生素是补充营养不足的有效手段，如在饵料中夹喂六合维生素或施尔康。在人工饲养条件下。如能避免单一或不适饵科的长期投喂，可以有效地避免营养障碍。
有些疾病的症状与营养障碍的症状相似，如感染性眼疾、肠梗塞等，在治疗时要予以综合考虑。
2、外伤 受伤的海龟要及时的隔离治疗，以避免伤口反复受伤。为了减少治疗过程中受惊，可将海龟放入特制的PVC治疗槽治疗，隔离治疗时使用28℃左右的新鲜海水，有助于早日恢复。外伤的治疗可用碘酒、红药水以及呋喃西林、云南白药等普通药物制成的药膏涂于患处，也可用60g／立方米～70g／立方米的氯霉素药浴。消除造成外伤的因素，保持适宜水温及水质的清洁；每天在玳瑁患部涂擦1～2次紫药水，效果显著。
3、感染症 一般情况下，海龟的感染性皮肤炎极少由单菌引起，所以不容易治疗。为了选择切实有效的药剂，进行药物实验是非常必要的，对感染性皮肤病的有效治疗是内服药与外用药结合使用。表l综合了照屋秀司和大连圣亚海洋世界对海龟感染症的治疗用药及方法。对感染性眼病的治疗，可将病龟隔离在治疗槽中，用抗生素眼膏或氧氟沙星等滴眼液治疗。
表1 海龟感染症的治疗用药及方法
福尔马林：药浴50～100g/立方厘米。
KMnO4：药浴2～5g/立方厘米。
伏碘：药浴50～100g/立方厘米；口服1．5～2．0g/kg；涂抹药膏。
红霉素：2～4g/立方厘米；涂抹药膏。
盐酸四环素：药浴0.3～0．6g/立方厘米；口服0．2～0．5g/kg。
土霉素：口服0．1～0-3g/kg；涂抹药膏。
磺胺类：口服0．1～0.3g/kg。
青霉素G：注射5～15万IU/kg。
硫酸庆大霉素：口服0．02～0．05g/kg；注射4～10万IU/kg。
硫酸卡那霉素：注射10～20万IU/kg。
4、感冒 肌注青霉素，安痛定，BLVL等；内服，轻氨卡青霉素胶囊，板蓝根等。
5、痢疾性肠炎 肌注氯霉素，黄莲素等；内服，氯霉素，黄莲素，吠喃哇酮。治愈后补充营养内服：多酶片，复合维生素B及维生素E、A，金钱草冲剂等，剂量因大小而定。。
此外，对于玳瑁的消化不良及肠炎症状，可以迅速提高水温，改善水质，喂食定时定量；注射黄连素和链霉素，待玳瑁食欲恢复正常，并正常排粪时可停止治疗。
6、肿脖子病 及时放水．用1％的硫酸铜溶液清洗、消毒水池，换含有2％食盐的新鲜水；用普鲁卡因青霉索4万IU／kg、硫酸链霉素5万IU／kg，每日1次，颈基部肌注；或用0．1％高锰酸钾或0．5％硫酸铜水溶液擦洗及浸泡30min．然后放入饲养池。以上方法，一般4～6d就可痊愈。
7、水霉病 做到勤换水，改善水质，对水池用1％硫酸铜溶液彻底消毒．并换上含有2％食盐的新水，调节好水温：用1％硫酸铜溶液对患部进行涂擦，直至擦掉溃疡伪膜(涂擦时避开健康的皮肤和眼睛)，然后再用0．5％硫酸铜溶液或0．1％的高锰酸钾对玳瑁全身进行擦洗及浸泡30min，最后在患部及全身涂擦紫药水。只要能恢复食欲，本病即可痊愈。
