通常细菌对动物机体的危害主要是通过进入机体并在体内繁殖，产生内外毒素、透明质酸酶、胶原酶或凝固酶等物质，造成动物机体的伤害。但丝状细菌对海洋动物的危害却有所不同。
研究表明，丝状细菌附着河蟹幼体时，仅附生于幼体的体表，没有明显的侵入幼体内部的结构，幼体体表也没有明显的病理变化；丝状细菌虽能利用多种糖类作为生长的营养来源，但其几丁质酶试验为阴性，证明丝状细菌并不能利用甲壳质，丝状细菌的附生不会对幼体的体表造成营养性侵害。因此，丝状细菌对河蟹幼体的危害只是一种物理性的危害。但研究同时发现，丝状细菌附生幼体时，幼体的附肢、眼等被重重缠绕，尤其是在关节处，导致活动不便，摄食受阻，生理机能下降，引起死亡。丝状细菌也能附生于溞状幼体的鳃部，刺激鳃部粘液分泌增加，使鳃部沾满污染物，导致呼吸困难，缺氧死亡。甲壳类动物在蜕壳时需要比平时更多的溶解氧，而丝状细菌对蜕壳过程有机械性的阻碍，当其大量生长时，不仅丝状细本身会消耗水中的氧气，而且会使鳃的表面与水接触面积减少，从而妨碍呼吸，导致死亡。因此，丝状细菌附生在幼体的体表，虽然没有对幼体产生直接的侵蚀或病理性损害，但对幼体的生长发育仍然是一种致命性的危害。
从丝细菌病的发生与流行来看，河蟹幼体在每次变态期的后期发病情况较严重。幼体变态时，丝状细菌会随着幼体的蜕皮而离开体表，使幼体暂时摆脱丝状细菌的感染。但是，由于幼体所蜕出的甲壳仍然存在于育苗水体中，丝状细菌并没有因为离开了幼体的体表而死亡，仍在水中继续生长繁殖，产生新的微生子而继续附生到已蜕皮的幼体体表上，使得丝状细菌对幼体的危害重新开始并持续存在。
