在同一地区、同一季节和基本相同的设备条件下，众多育苗厂的生产结果却呈现十分悬殊的差距，这其中单细胞藻类的培养是否成功起着关键的作用。由于泥蚶育苗池量多、季节长，中后期又处于高温季，因此，如何保证藻种不老化、不污染和保持稳定的供应量是泥蚶生产性育苗中单细胞藻类培养的要点。
筛选、对比、总结成功育苗厂的单细胞藻类培育经验，我们可以发现现今泥蚶育苗中的单细胞藻类培育生产工艺与虾蟹类苗种生产及扇贝、贻贝苗种生产和早期的泥蚶苗种生产中的单细胞藻类生产工艺已有了显著的改进。后者基本沿用教科书上的模式：藻种选用、一级封闭培养、二级小池中继培养、三级大池扩大培养；培养用海水先在消毒池中用漂白粉处理、硫代硫酸钠中和；培养池用高锰酸钾消毒、消毒海水清洗；将一级培养的藻种接入中继池、用中继培养的藻液给扩大培养的池子接种；接种水位一般在5－20ｃｍ，每日或隔日加水、施肥，用搅拌棒搅动培育的藻液。
新工艺加大了一级培养的份量，省略二级小池中继培养，代之以聚乙烯塑料薄膜袋充气吊挂和50Ｌ聚丙烯乳白塑料桶俗称"牛奶桶"蒙盖充气培养。三级大池培养采用原池消毒、高水位强光照充气培育。
现在让我们来看看泥蚶生产性育苗中单细胞藻类培养新工艺的生产过程。
藻种保养
泥蚶育苗中主要培养的单细胞藻类有：球等鞭金藻、叉鞭金藻、大溪地金藻、角毛藻、扁藻等。保种一般采用500－3000ｍＬ三角烧瓶培养，小室隔离，不与其它工作场所相通，自然采光加夜间日光灯照明，静水培养，一日2～3次摇晃，活动藻液。
一级培养
容器采用5000ｍＬ三角烧瓶、10000－20000ｍＬ细口玻璃瓶，目前更推广使用聚酯透明饮水桶（约18000ｍＬ）。后者重量轻、耐碰撞、透光性好、易清洗，但不耐强酸强碱和高温。一级培养一般采用静水培养，定时摇晃方式。也可采用微粒气石充气培养方式。后者培养速度明显加快，但易造成初级污染。静水培养可反复往下级培养接种，充气培养一般往下级接种3～5次后应全部更新，以防污染。
藻种扩大培养
大多采用单独搭棚构造，玻璃钢瓦覆顶，四周不筑墙，通风、采光极好，围以可收放的布帘，以免强光直晒和风雨吹淋。藻种培养采用30Ｌ有效水体25Ｌ聚乙烯塑料薄膜袋缩口吊挂充气培养或50Ｌ聚丙烯乳白塑料桶蒙以薄膜充气培养。培养用水经过煮沸消毒，接种后薄膜袋3～5天、塑料桶5～7天即可达到接种浓度。扩大培养的藻种可往大池接种2～3次，之后应从一级培养更新藻种，以防污染和藻种老化。
大池培养（生产性培养）
在藻类室的磁砖池或水泥池及少量育苗池中进行，新建育苗厂的藻类培养池大多用白水泥或涂料覆面的普通水泥池代替早期的磁砖池，同时用透明薄膜瓦取代部份玻璃钢以增加光照。
应用原池消毒法处理海水，方式有二种：
1.在消毒池中对海水施用漂白粉进行消毒，用消毒海水冲淋并泵入事先清洗好的藻类培养池，至预定水位，漂白粉施用6～8小时后可进行硫代硫酸钠中和，中和后曝气5～6小时即可接种。
2.将海水直接注入藻类培养池至预定水位，根据体积将定量的漂白粉施用于水中，充气20分钟后停气，进行海水消毒。6～8小时后施用相当于40％～50％漂白粉重量的硫代硫酸钠进行中和，大充气5～6小时后即可接种。
原池消毒充气培养法不再使用搅拌棒翻动培养的藻类，而用充气方式活动藻液。气石、气管在每次接种前都经煮沸消毒。气石分布密度为每平方米一个。
原池消毒充气培养法的优点在于：减少被污染途径，缩短劳动工序，加快培养速度。原池消毒对单细胞藻类培养池，尤其是磁砖贴面已老化的池子，消毒效果十分明显。藻类培养池池壁池底上的孔眼、缝隙、裂纹是污染生物理想的藏匿之处，在干露的池子里进行短时间的表面消毒，很难彻底杀灭这些污染生物。一但注水培养单细胞藻类，它们也随之渗出，造成污染。原池消毒法的浸泡方式让消毒海水直接渗进这些场所，杀死其中的污染生物。
应用原池消毒充气培养法进行单细胞藻类培养，初始水位较高，一般在40～60ｃｍ，如果辅以高光照、大充气，可以一次性到位在50～80ｃｍ，最高可至1ｍ。接种密度：金藻50000个细胞／ｍＬ，扁藻20000个细胞／ｍＬ。水位最好一次到位，分次添加一般不超过二次。藻类池每次使用后，用高浓度漂白粉消毒液淋壁洗刷，充气管、气头、沉石全部洗净，煮沸消毒，重新安插。
以这种方式进行单细胞藻类培养，金藻3～4天可达到投喂密度（120－200万个细胞／ｍＬ），扁藻4～6天可达到投喂密度（30－80万个细胞／ｍＬ）。
泥蚶育苗周期长达数月，目前不少育苗厂从3月即对亲贝进行升温促熟，4月初催产，5月开始出售蚶苗。而后期育苗，时间可延至10月。在如此长的时间跨度上，如何保证单细胞藻类培育正常和供应充足，除了合理的生产进度安排和严格的操作规范之外，藻种更新、高温季节管理、营养盐适配是需重点关注的三方面。
藻种更新
藻种更新是指单细胞藻种的一级培养和扩大培养，尤其是后者，在进行数次留底接种后，应重新培养，以保证藻种的纯度、新鲜度和低污染。另外，也需进行单细胞藻类适温品种更换，前期选用中低温品种，中后期采用高温品种。
高温季节管理
当培育水温达到28～29℃以上时单细胞藻类培养进入高温季节。水质变化大、易污染、藻体老化快是这个季节的特点。而藻体老化快发泡、粘壁、结块表现得最为明显。28～29℃以上的水温已超出了金藻和扁藻正常培育的温度，因此藻体老化快是正常现象。除了适宜的通风和降低光照外，主要应采用缩短培养时间的方法。高温季节金藻在接种后第三天即可达到投喂密度，投喂时间不要超过第五天；扁藻不超过一周。这样就可避免藻体在老化后被用于投喂。更新快是高温季节单细胞藻类培养的要点。相应的，营养液的施用应减少至适温期的60％～70％。
营养盐适配
在常规生产中，为方便起见，人们往往使用一种营养液给多种单细胞藻类培育施肥。其实各种单细胞藻类培育所需营养元素的量值是有差别的，在适宜条件下，这种差别的表现不甚明显。但在高温季节，这种差别就会影响某些单细胞藻类品种的生长。
以金藻和扁藻为例：在高温季节，用于金藻的营养母液的三种基本营养物硝酸钠、磷酸氢二钾、柠檬酸铁的用量分别为每升100ｇ、5ｇ、1ｇ；而扁藻的用量则为100ｇ、10ｇ、3ｇ。
另外，营养液的施用藻种保养为高量，一级培养和藻种扩养为中量，大池培养为低量。
一个苗池面积500ｍ2（有效水体700ｍ3）的育苗厂，单细胞藻类培养池面积应在200～250ｍ2（有效水位1ｍ）；藻种扩大培养应备有200只聚丙烯乳白塑料桶（有效水体10000Ｌ）或相应水体的聚乙烯塑料薄膜袋；藻种一级培养应备有50只聚酯透明饮水桶（有效水体800Ｌ）或相应水体的三角烧瓶和细口玻璃瓶；而藻种保养每个品种应有20Ｌ的存量。
