在河蟹幼体培育过程中，虽然严格要求清池和进水严密过滤，但仍不免会出现种种危害幼体的生物因子，严重影响幼体的成活率，因此对于幼体生物敌害的防治，不能不引起重视。生物敌害主要有菱形海发藻、聚缩虫、水蜈蚣、华鳔蚤和摇纹幼虫等。
１菱形海发藻
属浮游硅藻类羽纹藻目。其细胞以胶质相连成星状或锯齿状的群体，壳环面呈狭棒状，长３０～１１６μｍ，宽５～６μｍ。这种藻分布极广，附生于蚤状幼体身上，迅速大量繁殖。凡严重附生海发藻的蚤状幼体，不得安宁，加之不能正常摄食，而导致幼体大批死亡。对海发藻的防治迄今尚无理想的办法，只是采取严密过滤海水，加强换水和适当控制光照以及加温促进幼体变态等预
防性措施。
２ 聚缩虫
属原生动物门环毛目，单细胞个体着生许多纤毛，身体后端有一柄，固着于其它物体上，形成很大的群体，一受刺激，整个群体会收缩。聚缩虫附生于蚤状幼体后，迅速大量繁殖，严重者可超过幼体自身大小的２～３倍，使幼体漂浮于水面似白絮状，严重增加了幼体的负担和影响幼体生长发育，致使幼体大批死亡。除了聚缩虫外，有时还有一种单缩虫附生于幼体，危害亦很严重。单缩虫每一单细胞个体有一个短肌柄，附着于幼体，遍布全身，使幼体好象包了一层棉絮一样。聚缩虫和单缩虫的大量繁殖，与池水太肥，细菌增生有关，增加水体交换力度，使池水清净，减少聚缩虫的饵料，可以控制它的大量繁殖。
另外，由于盐水丰年虫卵也是带进培育池聚缩虫的一个污染源，因此，在孵化丰年虫无节幼体前，可以对卵加以消毒。池中出现聚缩虫可用１０×１０－６福尔马林杀灭。
３水蜈蚣
水蜈蚣又称水夹，是龙虱的幼体，对河蟹各期幼体危害较大，对水蜈蚣的防治，除了彻底清塘消毒外，对培育池中出现水蜈蚣，可采用捞海捕捉，也可用煤油点杀。
４华鳔蚤
在幼体培育池中，华鳔蚤等桡足类在优越的水体环境中迅速生长繁殖，形成优势种群与蚤状幼体争饵料、争氧气、争水体，影响幼体生存。凡是华鳔蚤在某个培育池中占优势，则幼体培育到第三期都困难。因此在培育池中对华鳔蚤千万不可引狼人室。解决办法是彻底清池消毒，进水时，海水经过严密过滤，防止带入六肢幼体及卵囊。
５摇纹幼虫
体呈蠕虫状，体色深红，因而也称血红虫。摇纹幼虫多数可在水底爬行，翻转运动，体长可达２０～４０ｍｍ。冬季在水底越冬，生活期可达１年以上。大多数摇纹幼虫是杂食性的，其中肉食性摇纹幼虫是典型的猎食动物，主要食物是甲壳类、水蚯蚓和其它摇纹幼虫，日食量可达体重的２０％，大量肉食性摇纹幼虫的存在，对蚤状幼体安全，具有直接威胁。对摇纹幼虫的防治，可在育苗结束后，育苗池用作养鱼时兼养鲤鱼，让鲤鱼吞食摇纹幼虫，达到杀灭目的。在清塘的药物中，福尔马林杀灭效果较好，敌百虫、漂白粉效果不佳。
６弹涂鱼
在幼体培育池中，鱼、虾等的存在，都会大量吞食，伤害各期幼体和大眼幼体，其中尤以弹涂鱼危害较大。防治方法，除了彻底清塘药物杀灭外，可在夜晚用手电筒照射捕捉。
