用中草药代替抗生素来防治疾病，不易产生抗药性和毒副作用，也不会污染水环境。而且，中草药对水产动物具有调节机体平衡与生理功能、提高机体特异性和非特异性免疫力、提高消化吸收、增强体质、促进生长的作用，此外还具有抗菌、抑制病毒等方面的作用。
鱼虾类育苗中的致病因素
1、育苗池水环境不良 在育苗过程中使用中草药防病，一方面可以调节幼体的代谢平衡，避免产生机能障碍；另一方面，中草药中的一些有效成分可以通过生物的、化学的、物理的作用，影响育苗池水环境，使其向着有利于幼体生长、发育的方向转化，而起到防病的作用。
2、幼体的饵料营养不良 中草药的调整作用具有调节幼体的生理功能，通过增强幼体对饵料的消化吸收，改良其代谢机能，从而对部分营养失调的饵料可起到一定的平衡作用，防止疾病发生。此外，有些中草药还具有明显的诱食性。
常用中草药有效成分与作用
中草药的化学成份极为复杂，一种中草药往往含有多种化学成份，但不是所有的成份都能起到防治疾病的作用，能防治疾病的有效成份主要包括多糖、生物碱、甙类、挥发油、鞣质等。
1、大蒜 大蒜具有广谱的抗菌作用，对病毒和原虫等都有杀灭作用，属高效抗菌杀虫中草药。在用作杀菌剂时，应新鲜制备，立即使用。
2、黄连 其有效成份为小檗碱(即黄连素)。黄连具有广谱抗菌作用，能抑制多种革兰阳性和阴性细菌的生长，对多种真菌有抑制作用，对一些病毒、原虫等也有效。另外，不檗碱还具有增强动物吞噬细胞的吞噬能力的作用。
3、黄芩 黄芩甙元是其主要有效成份。黄芩具有较广的抗菌谱，对革兰氏阴性和阳性球菌均有抑制作用，对一些病毒和多种真菌也有一定效果。
4、大黄 大黄含有大黄素、大黄酸、芦荟大黄素等葸醌类衍生物，具有抗细菌、抗真菌、抗病毒的作用，对屈桡杆菌有明显的抑制作用。此外，还具有收敛、防下泻、增加血小板、促进血液凝固的作用。
5、五倍子 五倍子含有鞣质等成份，对革兰氏阳性和阴性菌有抑制作用；对真菌(水霉病)具有良好的防治效果；还具有止血、解毒、收敛等作用。
6、大青叶和板兰根 大青叶是十字花科植物菘兰和爵床科植物马兰、蓼兰的叶子，板兰根就是菘兰的根。其有效成份为大青素、靛甙等。二者均有广抗菌和抗病毒作用及清热解毒作用。其中板兰根的抗病毒作用较强
鱼类育苗中中草药的使用
1、使用方法 鱼虾类育苗中中草药的使用可以一种药单独使用、也可几种药配伍使用。常用投药方法有：A、药浴法，将鲜草药捣碎或将干中草药煎成汁或粉碎浸泡取汁，均匀泼洒于育苗池中；B、药饵法，新鲜草药捣碎后拌入饵料中投喂，干中草药粉碎成细粉或煎成汁制成药饵投喂。
2、使用剂量 根据作者在鱼虾类人工育苗病害防治中中草药的使用实践，采用药浴法时中草药一次的使用剂量为2－5克每立方米；采用药饵法时中草药粉碎后按饵料重量(干重)0.5％－1.0％的比例拌入饵料中投喂。
由于中草药在鱼虾类人工育苗中的应用研究很少，一些育苗厂只是根据经验在使用。究竟哪些中草药最适于在鱼虾类人工育苗中使用，以及中药的有效使用剂量、作用机理等，还有待于以后进一步深入研究。
