由于大口鲇的抗病能力较强，所以饲养过程中较少患病。苗种阶段的常见病有白嘴白皮病、出血病、小瓜虫病和气泡病。成鱼阶段稍多见的病有肠炎病、烂鳃病和营养性综合症等。下面分别介绍其症状及防治方法。
1.白嘴白皮病。通常是由车轮虫、斜管虫寄生或由细菌引起，主要危害2～5厘米的苗种。其症状是体表局部和嘴圈周围呈苍白色，各鳍末端发白。防治方法：如系车轮虫等引起的,每立方米水体用硫酸铜0.2克加硫酸亚铁0.08克化水泼洒；若系细菌引起，则每立方米水体用0.3克强氯精或1克漂白粉全池泼洒，或每立方米水体用生石灰25～40克遍洒，连用2～3天，每天一次。
2.出血病。 由细菌引起，主要危害5厘米以下的苗种。发病水温24℃～31℃，高温期更易暴发。发病1～2天即开始大批死亡，死亡率极高。其症状是病鱼头顶部明显充血、出血，眼球突出，眼眶充血，鳍基也出血发红，体表充血发红，肛门红肿，肌肉呈局部点状或斑状出血，肠道充血发炎，部分病鱼的肝脾肾等内部器官也呈点状出血，胆囊有时肿大变色。防治方法：一是用1PPm的漂白粉或0.3ppm的强氯精全池泼洒，同时开始投喂药饵。药饵可用宁波市激素制品厂生产的“鱼血散”，第一天每万尾鱼种用药100克拌饲投喂,第二天药量减半，连喂5天；二是用适量的大黄氨水浸液全池泼洒,效果较好。
3.气泡病。主要危害水花鱼苗。这是由于水中的气体如氧气、氮气、二氧化碳、硫化氢等过饱和，小气泡附著在池底、池壁和鱼苗身上，有的鱼苗误以为是食物而吞下致病。症状是鱼体周身和肠胃里有透明的游离气泡，鱼苗因此失去平衡、游动失常而死亡。防治方法：一是必须施用发酵腐熟的粪肥作基肥；二是在培育鱼苗的水泥池上设遮荫物，避免阳光直晒；三是尽可能地在傍晚时分放养水花鱼苗，一旦发现患了气泡病，比较有 效的抢救方法是立即排除原池中的水，同时大量注入清新的水。
4.小瓜虫病。主要危害鱼苗鱼种。通常在4～6月和9～10月份流行。 症状是病鱼体表及鳍条鳃上有细小如针尖的白点,此即小瓜虫的囊泡。防治方法:一是用生石灰严格清塘消毒；二是用0.7ppm的硝酸亚汞液浸洗病鱼，浸洗时间随当时的水温而异;三可用30～40ppm的福尔马林液浸洗病鱼；四可用适量的干辣椒粉姜片和食盐煮成水剂全池泼洒。
5.肠炎病。主要危害大鱼种和成鱼。病鱼鳍基发炎充血，肛门红肿，不吃食常沿池边独游，几乎每天都有死鱼浮上水面并日趋增多，死鱼有腹水，肠道内无食物，有脓状血水。防治方法：一是不喂霉烂变质的饲料，定期在饲料中混入0.05%～0.1%的鲜蒜汁,结合定期泼洒生石灰浆;二是在每千克饲料中拌入痢特灵片5～10片、或庆大霉素针药1～2支，每天早晚各喂此药饵1次，连喂2～3天;也可在每千克饲料中加土霉素粉0.2～1克做成药饵喂鱼，连喂5～7天。
6.烂鳃病。主要危害成鱼。病鱼体色发黑，鳃丝颜色变淡，边缘附有污泥,严重时鳃丝烂成缺刻。流行于4～7月份。防治方法：用1ppm的漂白粉或15～20ppm的生石灰全池遍洒，同时每天用呋喃唑酮5～6克拌在50千克饲料中喂鱼，连喂5～6天。
7.营养性综合症。病鱼肝脏肿大，颜色粉白或发黄；胆囊亦肿大，胆汁变黑，病鱼零星死亡，而且往往最先死的是全体最大的鱼。防治方法：改进饲料配方，提高饲料质量，尤其要适当增加维生素和无机盐的用量。
需要特别强调的是，在生产实践中，鱼病的暴发往往是以并发症的形式出现的，对并发症的防治难度则更大。因此，做好日常饲养管理工作，采取综合预防措施，才能掌握鱼病防治的主动权。此外，由于大口鲇对各种药物都比有鳞鱼类更敏感，所以用药量和用药时间更要谨慎掌握，且在施药后的4小时内必须留专人监视鱼情，3小时后即向鱼池大量冲水，以防造成慢性药害。
