鱼病的正确诊断是决定治疗效果的关键。疾病的诊断难度很大，尤其是原发性病，因检查非常困难。而有些病如缺氧的诊断较容易，但氨氮中毒也可引起浮头，判断是什么因素引起的浮头必须靠经验和必要的化验手段才行。随着养殖环境的恶化，经常有许多病是由多种原因共同起作用的，必须通过对养殖环境的综合调查和必要的检测手段，才能确诊。
简单办法是将水样、料样和病鱼直接送到鱼病专家那里去诊断以便确诊并及时治疗。送检材料应选择有代表性的，病鱼最好是离群独游活动力差的鱼，死鱼、钩到的鱼或料台周围用网撒到的鱼都不是好材料。水样应选择发病严重池塘的水，饵料应取正在投喂的料。如果距离较远，送鱼时应用冰盒，里面放上冰，以保证鱼的新鲜，不要将不同养殖水体的鱼或水样放在一起。同时，应让了解该发病池塘养殖情况的人一起去，以便鱼病专家了解近期的养殖管理情况及用药情况、鱼的死亡情况、放养密度、鱼体大小、池塘深浅等，做出诊断及确定治疗时用药种类和剂量。
