1、缺氧死亡：鲢鱼抗低氧的能力很差，被称作鱼类缺氧浮头的“预报员”，水体缺氧时，鲢鱼先浮头，其次是鳙鱼。所以，把鲢鳙鱼作为水体是否缺氧的观察对象，及时施用应激灵和增氧灵，防止鲢鳙鱼死亡的同时，也防止了其他种类鱼缺氧死亡。
2、疾病死亡：过去认为鲢鳙鱼的疾病少，很少重视疾病防治。近年因高密度养殖，环境和养殖条件变化较大，新的鱼病也就发生了，尤其是暴发性的败血症常发生在鲢鳙鱼上。鲢鳙鱼败血症流行于6-10月，死亡高峰期为8-9月。发病池塘清塘消毒不严，淤泥厚，易使水质老化、恶化。拉网、寄生虫病发生后造成鱼体表受伤是染病的主要途径。
3、食物不足：鲢鳙都属滤食性鱼，以浮游生物、腐屑、菌落为食。鲢鱼以吃浮游植物（单胞藻类）为主，如果养殖鱼种类比例搭配不当，鲢鱼过多，或在水质恶化、环境突变时，藻类出现死亡的情况下，鲢鱼食物不足，弱小的鱼会因饥饿而体质衰弱，易染病而亡。鳙鱼以吃浮游动物为主，而浮游动物依赖浮游植物为生，如果养的鲢鱼过多，浮游植物被摄食，或浮游植物因水质不良死亡，浮游动物就更少，鳙鱼也因此缺乏足够的食物。如果同一池塘内只死鳙鱼，鲢鱼和其他鱼都不死，可能与放养鱼种类搭配不合理有关。
4、农药中毒：笔者在实践中发现鲢鱼对许多药物敏感，如对菊酯类、有机磷类、重金属类的某些品种都比较敏感。鱼塘附近农田的农药、某些工矿的废水、粉尘污染，都可能引起鲢鱼中毒乃至死亡。
