1、采苗时间
采苗时间要根据苗的具体发育情况确定，即通过溶壳检查或放散试验。当镜检丝状体有30％以上“双分”且镜头下大部分细胞形状规则，可以考虑开始采苗；当放散2万级以上时，也可以开始采苗。根据往年的经验确定壳孢子采苗时间和盲目跟从都不可取。可能造成在采苗时，壳孢子也许已经大量放散好几天了，壳孢子就白白地流失了一些，即“跑苗”或壳孢子不成熟，采苗后，适合壳孢子形成的最佳环境遭到破坏，以后通过流水刺激，壳孢子也能放散，但壳孢子个体小，质量差，附着率低，壳孢子下海生长效果差。
2、光线强度
光线的强度对壳孢子的采苗影响很大，在采苗开始前，便要考虑光线的因素，壳孢子采苗期间，我们要把育苗室里的采苗光强控制在3000lx以上。有的瓦房紫菜育苗室，或用于紫菜育苗的旧虾蟹育苗室等，光线强度差，采苗时，质量稍差的壳孢子游离在水中，有的壳孢子附在网帘上，但萌发速度慢，甚至几小时没有萌发，如果壳孢子放散高峰期正好碰上了阴雨天.壳孢子的有效利用率就更低了。如果在方便通风、调光的透明塑料薄膜大棚里进行壳孢子采苗效果可能会比较好。
另外，为了防止由于壳孢子采苗，丝状体长时间见不到光，造成形成的壳孢子色素淡、个体小、附着率低等。必须在下午结合拉网、整理贝壳等，让贝壳上的丝状体见光培养3～4h。
3、水温
紫菜壳孢子采苗，季节性强，为了保证采苗网帘在最佳时间下海。壳孢子采苗要在10月5日之前基本结束；同时，为了保证采苗能够顺利的进行，增加壳孢子的有效利用率，应该尽可能控制每天的水温降幅在0.5℃～1℃之间。果孢子采苗培养的丝状体，其壳孢子放散、附着的最适宜水温一般为18℃～23℃；而自由丝状体采苗培养的丝状体，其壳孢子放散、附着的最适宜水温一般为17℃～21℃。
在壳孢子采苗过程中，有一个非常重要的环节，即温差，温差下降幅度越大，壳孢子放散量越大，但这并不意味着采苗量多，因为温差越大(1.5℃以上)刺激放散的壳孢子畸形越多，壳孢子附着能力差。每天注意天气，防止冷空气突然南下，造成育苗水温下降幅度太大。采苗期间，水温稍有回升，壳孢子放散量就减少，所以采苗期间我们要尽量防止水温的回升.如在一般情况下，采苗期间，育苗池的水不要换。因为沉淀池的水温比育苗池的水温偏高，换水影响次日甚至几天的壳孢子放散量，当贝壳脏而采苗不顺利时才可以换水，或者为了防止阴雨天的壳孢子大量放散，造成壳孢子的流失，阴雨天的4：00～5：00进行换水(换水时，贝壳尽量不要露出水面)，人为提高苗池的水温。
4、冲水
4.1目的
将沉性的壳孢子从池底搅起，使壳孢子与网帘充分接触、附着、萌发；冲水将贝壳上的浮泥等附着物洗刷干净，有利于放散的壳孢子脱离贝壳表面；冲水刺激壳孢子成熟、放散，缩短壳孢子的采苗时间。认为冲水是为了把壳孢子喷洒到网帘上的理解是不准确的。
4.2提高冲水效果的方法
目前大部分育苗厂家使用1.3～2.5cm的水泵，冲水的力度不够，不能完全达到水泵冲水的目的，大量的壳孢子被浪费，延长了壳孢子的采苗时间，甚至错过了网帘下海的最佳时间。笔者认为用3.8～5.1cm的大水泵进行壳孢子采苗。采苗效果很好；如果使用1.3～2.5cm小水泵，要选择冲力大的水泵，如还感觉水泵冲力不够，可以在冲水管的出水口加细的小竹筒。增加水泵的冲水力度，必要时可以用几台水泵合起来冲某个池子。值得说明的是冲水量太大，能够促使壳孢子的大量放散，但壳孢子的附着率不高。笔者曾经将10平方米贝壳丝状体放在海边，让海水冲洗一夜，次日早上，壳孢子放散量达到千万级，但采苗量与放散量不成比例，且后来连续几天壳孢子放散量低，采苗量低；再如，将采苗期间的丝状体贝壳运到另外一个地方采苗，丝状体贝壳受到剧烈的颠簸等，在新地方的第一个早上，壳孢子放散量高。但采苗量不高，且以后连续几天壳孢子采苗量都不高。
4.3冲水时间
为了促使壳孢子早一些时间集中大量放散，在采苗前2～3d，在通风降温的同时.夜间要用水泵进行流水刺激。每天正常采苗时间是6：00～11：00，具体的采苗时间.要根据壳孢子的放散量及天气情况而定，放散高峰时，冲水时间最多可以延长到15：00，当阴雨天时，早上的冲水时间可以推迟至9：00以后。
5、海水比重
在适宜的比重范围内，比重越高，壳孢子附着效果越好，壳孢子有效利用率越高。在连云港地区，采苗的海水比重是1.020～1.024。在江苏省的南通地区。许多育苗厂将采壳孢子的海水比重调到1.018～1.020，认为这样的海水比重采苗效果最好。笔者开始以为这可能是地区特点.经过在当地的几年紫菜育苗技术服务后，笔者不赞成这种看法，认为最佳的采苗海水比重应是1.020～1.024。在盐城等地区，壳孢子采苗时，当地的海水此重低于1.015，有的厂家向海水里加盐或老卤，以便提高采苗海水的盐度，其效果并不理想。笔者在盐城滨海培育紫菜苗时，曾用原卤调节采苗海水的比重，效果很好。
6、网帘的出池时间以及暂养
6.1出池时间
在壳孢子采苗的高峰期，需将出池的网帘放在原采苗池暂养15min以上，待网帘上的壳孢子基本萌发后再出池。许多厂家因为担心网帘在采苗池里多放一些时间，就有更多的壳孢子附着在网帘上，影响了下一批网帘的采苗，所以一旦检查网帘上壳孢子的密度够了，也不管其萌发与否，强行将网帘出池，由于出苗速度太快，网帘下海后，空网是常有的事情。事实上，当网帘上的壳孢子密度达到采苗要求时，停止一段时间的冲水，大部分未附着的壳孢子下沉池底.网帘上的壳孢子拉长萌发，这样既不会造成网帘空网，也不会影响下一批网帘的采苗。
6.2网帘暂养
出池的网帘如不能及时下海张挂，要进行暂养。目前常用的暂养方式是将网帘打包后，浸没在一个水池中暂养，笔者认为将网帘张挂在背阴处，定期淋水保持网帘湿润。也是一种比较好的网帘暂养方式。
