1、挂篓（袋）法
在食场周围悬挂盛药的袋或篓，形成一消毒区，当水产动物来摄食时达到消灭体外病原体的目的。此法具有用药量少、方便简单、没有危害及副作用小等优点，一般须持续挂药3天左右。此法主要用于网箱养殖区域或大水面养殖。
2、药浴法
将水产动物集中在较小容器、较高浓度药液中进行短期强迫药浴，以杀灭体外病原体。此法具有用药少、方便简单、副作用小的优点。此法一般用于转池及运输前后消毒鱼体，在网箱养鱼也常采用此法。
3、遍洒法
全池遍洒药液，使池水达到一定浓度，杀灭体外及池水中的病原体。此法在外用药中杀灭病原体较彻底，预防、治疗均可用。但此法用药量较前两种方法要大，计算池水体积比较麻烦，如药物的安全范围较小时，使用不慎，容易发生事故，副作用也较大。
4、浸沤法
将草药浸沤在池塘的上风处或将捆扎好的中草药分成数堆，杀灭池水中及体外的病原体。此法适用于预防及早期治疗。
5、涂抹法
在体表患病处涂抹较浓的药液或药膏以杀灭病原体。此法适用于产卵后受伤的亲本及名贵品种。此法用药量少，方便、安全、副作用小。涂抹时头部一定要向上，以防药液流入鱼鳃，产生危险。
6、口服法
将药物或疫苗与水产动物喜吃的饲科混合，拌以粘合剂，制成适口的颗粒药饲投喂，杀灭体内的病原体或增强抗病力。此法适用于预防及治疗，但当病情严重，病体已停止摄食或很少摄食时则无效。
7、注射法
常用的注射法有腹腔注射和肌肉注射。注射法较口服法进入体内的药量准确，且吸收快、疗效好、用药量少，但太麻烦。所以一般只在亲体及人工注射疫苗时采用；名贵品种有时也采用此法。
